More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0909 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0909  NMT1/THI5 like domain protein  100 
 
 		 311 aa  629  1e-179  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0643839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3655  NLPA lipoprotein  75.85 
 
 		 311 aa  473  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0036  NlpA lipoprotein  66.33 
 
 		 323 aa  424  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0213  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  61.01 
 
 		 322 aa  409  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0204  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  60.69 
 
 		 322 aa  409  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0280  NMT1/THI5-like domain-containing protein  59.43 
 
 		 322 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1642  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  57.95 
 
 		 335 aa  358  7e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456194  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  57.19 
 
 		 311 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1934  NLPA lipoprotein  56.51 
 
 		 329 aa  353  1e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0586  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  58.56 
 
 		 309 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0646  ABC transporter, substrate-binding protein  57.53 
 
 		 311 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.714673  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2299  ABC transporter, substrate-binding protein  57.53 
 
 		 311 aa  348  5e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0813032 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0489  hypothetical protein  54.58 
 
 		 315 aa  321  9.000000000000001e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06841  nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components  51.31 
 
 		 337 aa  315  5e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000866  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter substrate-binding component  50.98 
 
 		 316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2375  ABC transporter substrate-binding protein  50.17 
 
 		 312 aa  309  2.9999999999999997e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3125  NMT1/THI5-like domain-containing protein  47.18 
 
 		 311 aa  288  7e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1887  NMT1/THI5 like domain protein  45.7 
 
 		 319 aa  241  9e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.50224  normal  0.0288593 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2297  NMT1/THI5 like domain protein  40.21 
 
 		 312 aa  210  3e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  36.22 
 
 		 328 aa  162  7e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1642  NMT1/THI5 like domain protein  32.75 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.52 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  33.61 
 
 		 333 aa  142  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  33.61 
 
 		 333 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  33.07 
 
 		 333 aa  142  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  33.07 
 
 		 333 aa  142  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  33.61 
 
 		 333 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  33.07 
 
 		 333 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  32.68 
 
 		 333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  33.61 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  32.68 
 
 		 333 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  32.68 
 
 		 333 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  29.1 
 
 		 336 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30906  predicted protein  26.81 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.407472  normal  0.0307188 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  30.26 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.26 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1522  hypothetical protein  24.36 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0878  NMT1/THI5 like domain protein  28.52 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000508636  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1461  hypothetical protein  24.51 
 
 		 314 aa  106  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08009  thiamine biosynthesis protein (Eurofung)  24.28 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504438  normal  0.187766 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4877  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.32 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0371  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.43 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  27.02 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0447  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.46 
 
 		 332 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0368  ABC transporter substrate-binding protein  25.98 
 
 		 332 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0358  ABC transporter, substrate-binding protein  25.98 
 
 		 332 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0355  ABC transporter, substrate-binding protein  25.98 
 
 		 332 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0425  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.98 
 
 		 332 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0382  ABC transporter substrate-binding protein  25.98 
 
 		 332 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0494  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.98 
 
 		 332 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0363  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.46 
 
 		 332 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2330  thiamine biosynthesis protein, putative  26.62 
 
 		 303 aa  102  8e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0492  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.26 
 
 		 332 aa  102  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0477  NMT1/THI5 like domain protein  26.12 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  26.72 
 
 		 327 aa  99  9e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.99 
 
 		 329 aa  94  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  26.64 
 
 		 331 aa  92.4  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1444  NMT1/THI5-like protein  24.77 
 
 		 318 aa  90.9  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.477186 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  27.5 
 
 		 328 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.94 
 
 		 329 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  28.97 
 
 		 334 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3936  NMT1/THI5 like domain protein  28.75 
 
 		 336 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  30 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.68 
 
 		 331 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  26.9 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1222  NMT1/THI5 like domain protein  24.51 
 
 		 360 aa  85.9  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  28.86 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0121  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  28.03 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3647  NMT1/THI5 like domain protein  28.03 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.29 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  27.52 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33535  predicted protein  26.55 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2040  NMT1/THI5 like domain protein  25.82 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  27.71 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0306  twin-arginine translocation pathway signal  26.6 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0392  NMT1/THI5 like domain protein  26.51 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0243  ABC transporter, permease protein, putative  25 
 
 		 587 aa  77.4  0.0000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  28.17 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3043  NMT1/THI5 like domain protein  24.19 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4670  NMT1/THI5 like domain protein  25.51 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  26.4 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1152  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.35 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.63 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  25.27 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6030  putative ABC transporter, substrate binding protein  26.25 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1721  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.42 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal  0.736062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3018  NMT1/THI5 like domain protein  28.62 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0655  NMT1/THI5-like protein  27.67 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.37 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0451  NMT1/THI5 like domain protein  33.59 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  normal  0.0280986 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1941  NMT1/THI5 like domain protein  25.09 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.876036  hitchhiker  0.000270678 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6283  NMT1/THI5 like domain protein  27.42 
 
 		 381 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4165  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.43 
 
 		 331 aa  72  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0994431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13660  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  23.32 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1093  NMT1/THI5 like domain protein  26.12 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000718314  normal  0.110975 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2591  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.96 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.329095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1669  NMT1/THI5 like domain protein  26.24 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.833326  normal  0.535701 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  25.87 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  24.67 
 
 		 778 aa  69.7  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1374  NMT1/THI5 like domain protein  25.1 
 
 		 329 aa  68.9  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.353892  normal  0.853253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>