145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0903 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0903  hypothetical protein  100 
 
 		 537 aa  1072    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0493505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4058  hypothetical protein  52.45 
 
 		 545 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00410401  normal  0.150946 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2146  hypothetical protein  32.16 
 
 		 520 aa  226  7e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52010  hypothetical protein  32.22 
 
 		 508 aa  222  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269722  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0464  protein of unknown function DUF323  30.19 
 
 		 511 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4233  hypothetical protein  30.17 
 
 		 511 aa  214  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0277487  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2877  hypothetical protein  34.78 
 
 		 502 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.112467  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2626  hypothetical protein  34.58 
 
 		 515 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00927742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3148  hypothetical protein  39.62 
 
 		 515 aa  199  9e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.358064  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3222  protein of unknown function DUF323  32.83 
 
 		 512 aa  187  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33154  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1319  protein of unknown function DUF323  30.8 
 
 		 569 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3870  hypothetical protein  38.43 
 
 		 538 aa  169  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0563781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00830  hypothetical protein  31.79 
 
 		 570 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.313618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3133  hypothetical protein  37.8 
 
 		 538 aa  167  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.280232  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0142  hypothetical protein  31.55 
 
 		 570 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3420  hypothetical protein  36.65 
 
 		 538 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.657429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2310  hypothetical protein  29.83 
 
 		 601 aa  152  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0333269  hitchhiker  0.0000166266 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1667  hypothetical protein  32.01 
 
 		 569 aa  104  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  29.03 
 
 		 586 aa  70.9  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  31.79 
 
 		 336 aa  70.1  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  28.19 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4067  protein of unknown function DUF323  29.61 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000050809  hitchhiker  0.0000128924 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  30.6 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  31.16 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  31.41 
 
 		 768 aa  63.5  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5254  hypothetical protein  30.88 
 
 		 233 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410558  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  27.87 
 
 		 262 aa  62.4  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  35.44 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7515  hypothetical protein  29.95 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  28.14 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2311  hypothetical protein  27.36 
 
 		 224 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.254882  normal  0.0358095 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2986  hypothetical protein  26.9 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0027982  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0993  protein of unknown function DUF323  30.3 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  23.02 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  30.38 
 
 		 922 aa  57.8  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  24.11 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  27.87 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3831  protein of unknown function DUF323  30.73 
 
 		 223 aa  57  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1865  protein of unknown function DUF323  24.26 
 
 		 289 aa  57  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000544959  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4110  protein of unknown function DUF323  30.21 
 
 		 293 aa  56.6  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2903  protein of unknown function DUF323  27.31 
 
 		 327 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0833  putative lipoprotein  26.46 
 
 		 341 aa  56.2  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000110547  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4405  protein of unknown function DUF323  27.17 
 
 		 334 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  27.74 
 
 		 882 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  27.75 
 
 		 446 aa  55.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  30.5 
 
 		 293 aa  56.2  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0252  protein of unknown function DUF323  33.66 
 
 		 262 aa  55.5  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.531607  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  28.66 
 
 		 398 aa  55.1  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  25.5 
 
 		 617 aa  54.7  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  27.65 
 
 		 603 aa  54.7  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  24.01 
 
 		 433 aa  54.3  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  32 
 
 		 523 aa  54.3  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1056  hypothetical protein  33.04 
 
 		 201 aa  54.3  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000574228  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  26.63 
 
 		 298 aa  53.9  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  28.83 
 
 		 267 aa  53.9  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3542  hypothetical protein  28.91 
 
 		 230 aa  53.9  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2239  hypothetical protein  28.33 
 
 		 330 aa  53.5  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0453686  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  27.64 
 
 		 616 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  30.81 
 
 		 668 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  27.86 
 
 		 740 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  27.73 
 
 		 269 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  28.02 
 
 		 292 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  27.27 
 
 		 636 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1675  hypothetical protein  28.64 
 
 		 488 aa  52.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  30.7 
 
 		 359 aa  52.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  25.69 
 
 		 517 aa  52.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  26.18 
 
 		 263 aa  52.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  31.68 
 
 		 291 aa  52  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1133  protein of unknown function DUF323  27.17 
 
 		 321 aa  52  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.316154  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  27.75 
 
 		 952 aa  52  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  31.44 
 
 		 253 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0206  protein of unknown function DUF323  23.86 
 
 		 287 aa  51.2  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  23.72 
 
 		 267 aa  50.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3794  hypothetical protein  23.89 
 
 		 286 aa  50.8  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000288368  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  31.61 
 
 		 289 aa  50.8  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  27.95 
 
 		 877 aa  50.8  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1268  serine/threonine protein kinase  29.1 
 
 		 509 aa  50.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2101  hypothetical protein  28.28 
 
 		 356 aa  49.7  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00076564  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  24.08 
 
 		 587 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  28.57 
 
 		 820 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 554 aa  50.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3216  hypothetical protein  26.63 
 
 		 296 aa  49.7  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  29.7 
 
 		 570 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  27.69 
 
 		 535 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0977  hypothetical protein  30.5 
 
 		 381 aa  48.9  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000230443  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16100  hypothetical protein  33.61 
 
 		 237 aa  49.3  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.719572  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  23.74 
 
 		 358 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2802  hypothetical protein  26.15 
 
 		 214 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  35.63 
 
 		 527 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2485  putative cytoplasmic protein  23.86 
 
 		 226 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.848357  normal  0.715845 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  29.14 
 
 		 925 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  24.62 
 
 		 1104 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  25.58 
 
 		 1911 aa  48.9  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1711  serine/threonine protein kinase  26.42 
 
 		 1043 aa  48.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.610631  normal  0.122083 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2601  hypothetical protein  24.54 
 
 		 225 aa  47.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.683008  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  27.59 
 
 		 351 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  24.46 
 
 		 751 aa  47.8  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  26.45 
 
 		 654 aa  47.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  26.16 
 
 		 892 aa  47.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2805  putative cytoplasmic protein  22.84 
 
 		 226 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>