More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0577 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 483 aa  988    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3381  aldehyde dehydrogenase  72.71 
 
 		 482 aa  728    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.464458  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2694  aldehyde dehydrogenase family protein  64.26 
 
 		 480 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  64.26 
 
 		 480 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1815  aldehyde dehydrogenase  60.08 
 
 		 491 aa  610  1e-173  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  60.43 
 
 		 486 aa  598  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  58.94 
 
 		 480 aa  585  1e-166  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1240  aldehyde dehydrogenase  59.87 
 
 		 484 aa  587  1e-166  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208234 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05501  hypothetical protein  59.15 
 
 		 486 aa  587  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2128  aldehyde dehydrogenase  57.87 
 
 		 486 aa  584  1.0000000000000001e-165  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0517784  hitchhiker  0.00570201 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0877  aldehyde dehydrogenase  57.66 
 
 		 487 aa  584  1.0000000000000001e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0813  aldehyde dehydrogenase  56.81 
 
 		 482 aa  560  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  57.41 
 
 		 479 aa  560  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  59.54 
 
 		 485 aa  548  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2844  aldehyde dehydrogenase  58.53 
 
 		 482 aa  550  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281069  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  59.54 
 
 		 485 aa  546  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  56.04 
 
 		 479 aa  546  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  56.12 
 
 		 480 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3422  aldehyde dehydrogenase  57.59 
 
 		 479 aa  535  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2664  aldehyde dehydrogenase  57.74 
 
 		 480 aa  537  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  55 
 
 		 481 aa  533  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1732  Aldehyde Dehydrogenase  57.75 
 
 		 478 aa  533  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0174509  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6489  aldehyde dehydrogenase  56.69 
 
 		 482 aa  533  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  55.39 
 
 		 480 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  54.64 
 
 		 477 aa  531  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  55.18 
 
 		 480 aa  530  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  55.06 
 
 		 498 aa  526  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1598  aldehyde dehydrogenase  56.3 
 
 		 479 aa  527  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  54.43 
 
 		 477 aa  524  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  54.01 
 
 		 477 aa  518  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  54.16 
 
 		 475 aa  518  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  54.22 
 
 		 477 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  54.43 
 
 		 477 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1119  aldehyde dehydrogenase  57.81 
 
 		 479 aa  518  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65747 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  54.17 
 
 		 478 aa  512  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  55.51 
 
 		 477 aa  514  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0247  aldehyde dehydrogenase  58.13 
 
 		 482 aa  513  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  55.63 
 
 		 482 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6141  aldehyde dehydrogenase  56.19 
 
 		 446 aa  496  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  52.67 
 
 		 476 aa  497  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0452  aldehyde dehydrogenase  53.72 
 
 		 480 aa  498  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1025  aldehyde dehydrogenase  53.29 
 
 		 480 aa  495  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3017  aldehyde dehydrogenase  54.56 
 
 		 478 aa  486  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1043  Aldehyde Dehydrogenase  52.75 
 
 		 483 aa  484  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2256  aldehyde dehydrogenase  50.52 
 
 		 478 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134767  hitchhiker  0.000000459097 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3959  Aldehyde Dehydrogenase  49.89 
 
 		 482 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.424065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1054  aldehyde dehydrogenase  58.81 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  44.14 
 
 		 482 aa  378  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  42.95 
 
 		 483 aa  377  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  41.54 
 
 		 479 aa  373  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  41.96 
 
 		 498 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  42.23 
 
 		 483 aa  354  2e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  38.75 
 
 		 493 aa  353  5e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3632  aldehyde dehydrogenase family protein  42.83 
 
 		 482 aa  352  8.999999999999999e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  42.41 
 
 		 516 aa  348  8e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  38.69 
 
 		 505 aa  348  9e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  38.91 
 
 		 500 aa  346  5e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  39.57 
 
 		 503 aa  346  5e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  38.16 
 
 		 496 aa  346  6e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  37.34 
 
 		 499 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  43.37 
 
 		 488 aa  345  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  39.57 
 
 		 497 aa  344  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  41.56 
 
 		 496 aa  342  7e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  40.25 
 
 		 498 aa  340  4e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  41.09 
 
 		 481 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  40.96 
 
 		 482 aa  336  5e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  36.55 
 
 		 498 aa  335  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  37.8 
 
 		 485 aa  330  3e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4351  aldehyde dehydrogenase  40 
 
 		 491 aa  329  6e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  39.54 
 
 		 493 aa  329  6e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  39.11 
 
 		 485 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  39.16 
 
 		 493 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  36.94 
 
 		 496 aa  320  3e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0846  aldehyde dehydrogenase  39.79 
 
 		 493 aa  318  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  44.07 
 
 		 474 aa  317  2e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  37.53 
 
 		 484 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  36.79 
 
 		 478 aa  311  1e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  40.08 
 
 		 483 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  37.5 
 
 		 480 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.66 
 
 		 498 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1076  aldehyde dehydrogenase  42.95 
 
 		 505 aa  307  3e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.992962  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1328  aldehyde dehydrogenase  41.34 
 
 		 483 aa  306  6e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  38.18 
 
 		 510 aa  306  6e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.08 
 
 		 480 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.14 
 
 		 483 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.26 
 
 		 508 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.95 
 
 		 480 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  34.79 
 
 		 490 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  38.78 
 
 		 480 aa  304  3.0000000000000004e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  37.21 
 
 		 491 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  37.14 
 
 		 490 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  38 
 
 		 488 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.5 
 
 		 483 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  36.76 
 
 		 494 aa  302  1e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  37.73 
 
 		 489 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  37.73 
 
 		 489 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3306  Aldehyde Dehydrogenase  42.58 
 
 		 497 aa  300  3e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.35 
 
 		 483 aa  300  5e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.02 
 
 		 495 aa  299  7e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2257  aldehyde dehydrogenase  39.61 
 
 		 457 aa  299  7e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.955322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>