More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1008 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1008  peptidase M24  100 
 
 		 408 aa  836    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.998563  normal  0.0392371 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1734  peptidase M24  57 
 
 		 407 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00987909  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1989  peptidase M24  54.68 
 
 		 407 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.758645  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3039  peptidase M24  54.07 
 
 		 419 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0333665 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1305  M24 family peptidase  53.58 
 
 		 414 aa  441  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.67819  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0541  peptidase M24  36.48 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0770334  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2216  peptidase M24  36.48 
 
 		 397 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0649  Xaa-Pro aminopeptidase  36.87 
 
 		 397 aa  270  4e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0565  peptidase M24  34.56 
 
 		 397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0612  hypothetical protein  36.39 
 
 		 397 aa  259  6e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2163  peptidase M24  36.83 
 
 		 397 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000118517  normal  0.0215342 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0353  peptidase M24  36.09 
 
 		 399 aa  256  5e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0162  peptidase M24  38.75 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2614  Xaa-Pro aminopeptidase  38.78 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1223  peptidase M24  35.71 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1630  peptidase M24  35.55 
 
 		 395 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.339878 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0888  peptidase M24  34.78 
 
 		 397 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0261392  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2005  peptidase M24  33.93 
 
 		 400 aa  209  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1135  peptidase M24  30.05 
 
 		 398 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0425552  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1321  peptidase M24  33.59 
 
 		 398 aa  201  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1720  peptidase M24  32.16 
 
 		 389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3617  peptidase M24  34.76 
 
 		 387 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.335337  hitchhiker  0.00408279 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0984  peptidase M24  31.53 
 
 		 390 aa  195  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3318  peptidase M24  31.89 
 
 		 397 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.971608  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1380  creatinase  28.79 
 
 		 396 aa  192  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0434846  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1345  peptidase M24  31.39 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2690  peptidase M24  28.22 
 
 		 397 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000610449  normal  0.0752644 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1962  Xaa-Pro aminopeptidase  33.33 
 
 		 405 aa  190  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1105  xaa-pro dipeptidase  28.15 
 
 		 397 aa  188  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.071673  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1765  creatinase  29.75 
 
 		 397 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1575  creatinase  26.8 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0445015  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1377  peptidase M24  31.46 
 
 		 388 aa  183  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.209377 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2836  peptidase M24  31.2 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000117604  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1813  peptidase M24  32.91 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000026363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2518  peptidase M24  29.18 
 
 		 390 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1905  peptidase M24  28.14 
 
 		 397 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0678501 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1399  creatinase  29.87 
 
 		 402 aa  176  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2562  peptidase M24  28.04 
 
 		 396 aa  173  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6562099999999997e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1651  peptidase M24  28.29 
 
 		 396 aa  172  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2186  peptidase M24  29.64 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0133424  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0889  M24 family peptidase  29.27 
 
 		 398 aa  160  5e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2855  peptidase M24  29.57 
 
 		 394 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  26.63 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  26.38 
 
 		 359 aa  100  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  24.31 
 
 		 359 aa  93.2  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0663  peptidase M24  27.65 
 
 		 387 aa  89.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0650  peptidase M24  26.7 
 
 		 363 aa  88.6  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1099  peptidase M24  23.27 
 
 		 356 aa  87.8  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  24.11 
 
 		 353 aa  87  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  28.82 
 
 		 373 aa  87.4  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  27.72 
 
 		 348 aa  85.9  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  24.31 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0632  peptidase M24  26.87 
 
 		 364 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5851  peptidase M24  25.68 
 
 		 369 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.844746 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  24.62 
 
 		 357 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  24.93 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1724  peptidase M24  21.3 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  26.42 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1673  peptidase M24  27.54 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0480617  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  25 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1560  peptidase M24  24.93 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  24.37 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  25 
 
 		 364 aa  79.7  0.00000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  21.91 
 
 		 361 aa  79.3  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  24.49 
 
 		 354 aa  79.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_622  Xaa-Pro aminopeptidase  25.99 
 
 		 362 aa  79.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  24.83 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_002936  DET0715  M24 family metallopeptidase  25.74 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.775303  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  26.98 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2026  peptidase M24  24.17 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.442102  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5221  peptidase M24  25.3 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0493445  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1923  peptidase M24  23.2 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.412191  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07860  Xaa-Pro aminopeptidase  25.17 
 
 		 374 aa  76.3  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623606 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  25.64 
 
 		 375 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0108  peptidase M24  24.7 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  23.65 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  23.39 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  21.21 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21880  Xaa-Pro aminopeptidase  27.59 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122866  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1224  peptidase M24  23.42 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  23.39 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  23.39 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  23.39 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  23.39 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2591  peptidase M24  25 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  23.39 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0992  peptidase M24  24.06 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.239876  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  25.72 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  23.68 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  23.39 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0480  peptidase M24  22.58 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2024  peptidase M24  27.69 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.711973  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1824  peptidase M24  26.41 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000132868  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  20.88 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  20.88 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  24.62 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.445473 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2546  peptidase M24  27.65 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.874302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  23.65 
 
 		 353 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  26.09 
 
 		 367 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4077  peptidase M24  24.23 
 
 		 388 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>