89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0621 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0621  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 575 aa  1203    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  hitchhiker  0.00000449276 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1901  transposase  54.45 
 
 		 586 aa  661    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0330742  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4038  transposase-like protein  29.81 
 
 		 570 aa  242  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0359  transposase-like protein  29.81 
 
 		 570 aa  242  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1836  transposase-like protein  29.81 
 
 		 570 aa  242  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.659926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2540  transposase-like protein  29.81 
 
 		 570 aa  242  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.184264 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3856  transposase-like protein  29.81 
 
 		 570 aa  242  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1977  transposase  23.43 
 
 		 555 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000110578  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3734  hypothetical protein  54.35 
 
 		 100 aa  120  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.122747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  21.44 
 
 		 562 aa  84.3  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3710  Transposase-like protein  20.04 
 
 		 586 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3301  Transposase-like protein  20.04 
 
 		 586 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2500  Transposase-like protein  20.04 
 
 		 586 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.950355  normal  0.049375 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1823  Transposase-like protein  20.04 
 
 		 586 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.615645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0523  Transposase-like protein  20.04 
 
 		 586 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0784  transposase, IS4 family protein  20.43 
 
 		 562 aa  80.5  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  21.88 
 
 		 596 aa  80.1  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  21.88 
 
 		 596 aa  79  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  21.68 
 
 		 596 aa  78.6  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0325  transposase, IS4 family protein  24.5 
 
 		 554 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  21.68 
 
 		 562 aa  76.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  21.47 
 
 		 562 aa  74.7  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1109  transposase IS4 family protein  22.39 
 
 		 538 aa  74.3  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.659688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1144  transposase IS4 family protein  22.39 
 
 		 538 aa  74.3  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.923629  normal  0.0203233 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2668  transposase IS4 family protein  22.39 
 
 		 538 aa  74.3  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.641084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3173  transposase IS4 family protein  22.39 
 
 		 538 aa  74.3  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3060  transposase IS4 family protein  22.32 
 
 		 579 aa  72.8  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1552  transposase IS4 family protein  21.74 
 
 		 558 aa  72.8  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3755  transposase, IS4 family protein  23.92 
 
 		 566 aa  70.9  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0348  transposase IS4 family protein  20.51 
 
 		 566 aa  69.7  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178461  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3569  transposase IS4 family protein  23.76 
 
 		 586 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1559  transposase IS4 family protein  23.76 
 
 		 555 aa  67.4  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4150  hypothetical protein  39.44 
 
 		 123 aa  65.1  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1626  transposase IS4 family protein  21.47 
 
 		 629 aa  65.5  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.546345 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0053  transposase, IS4 family protein  21.33 
 
 		 632 aa  64.7  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000750234  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1759  transposase, IS4 family protein  21.33 
 
 		 632 aa  64.7  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.518431  normal  0.0966582 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1981  transposase, IS4 family protein  21.33 
 
 		 632 aa  64.7  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3637  transposase, IS4 family protein  21.33 
 
 		 632 aa  64.7  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1526  transposase, IS4 family protein  21.33 
 
 		 632 aa  64.7  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000549576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2508  transposase, IS4 family protein  21.33 
 
 		 632 aa  64.7  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152429  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2452  transposase, IS4 family protein  21.33 
 
 		 632 aa  64.7  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000508374  normal  0.561674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2203  transposase, IS4 family protein  21.33 
 
 		 632 aa  64.7  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.477552  normal  0.262943 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1199  transposase IS4 family protein  23.97 
 
 		 540 aa  64.7  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0336  transposase IS4 family protein  23.97 
 
 		 540 aa  64.7  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3900  transposase IS4 family protein  21.52 
 
 		 587 aa  63.9  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.44467 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2943  transposase IS4 family protein  21.52 
 
 		 587 aa  63.9  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3223  transposase, IS4 family protein  21.52 
 
 		 548 aa  63.9  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.505211  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3161  transposase, IS4 family protein  21.52 
 
 		 547 aa  63.5  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0517  transposase IS4 family protein  22.5 
 
 		 558 aa  62  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1955  transposase  23.09 
 
 		 578 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0958  transposase  23.09 
 
 		 578 aa  57.8  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3379  transposase, IS4 family protein  18.9 
 
 		 559 aa  57.4  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0721  transposase  23.09 
 
 		 578 aa  56.6  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1854  transposase IS1634 family protein  26.42 
 
 		 532 aa  56.2  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1448  transposase IS1634 family protein  26.42 
 
 		 532 aa  56.2  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  21.08 
 
 		 561 aa  54.3  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0572  transposase IS4 family protein  22.44 
 
 		 511 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0558  transposase  24.68 
 
 		 449 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  21.26 
 
 		 548 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  21.26 
 
 		 548 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  21.26 
 
 		 548 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1523  transposase, IS4  24.88 
 
 		 536 aa  52  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.833307  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4459  transposase IS1634 family protein  25 
 
 		 526 aa  50.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2371  transposase IS4 family protein  22.2 
 
 		 511 aa  51.2  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2142  transposase IS4 family protein  22.18 
 
 		 520 aa  50.4  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1562  transposase IS4 family protein  22.18 
 
 		 520 aa  50.4  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1050  transposase IS4 family protein  22.18 
 
 		 520 aa  50.4  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0161  transposase IS4 family protein  22.18 
 
 		 520 aa  50.4  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02905  Transposase, IS4 family protein  20.41 
 
 		 544 aa  50.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00174  Transposase, IS4 family protein  20.41 
 
 		 544 aa  50.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1742  transposase  23.18 
 
 		 531 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12588  normal  0.422526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3656  transposase  23.18 
 
 		 531 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.36895  normal  0.0449577 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1382  transposase, IS4 family protein  22.49 
 
 		 563 aa  48.5  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0721927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0410  transposase IS4 family protein  22.71 
 
 		 510 aa  47.8  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.18418  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2631  transposase, IS4 family protein  21.94 
 
 		 487 aa  46.6  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1993  transposase, IS4 family protein  22.19 
 
 		 509 aa  46.6  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.458158  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2639  IS4 family transposase  21.46 
 
 		 537 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.110889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2846  IS4 family transposase  21.46 
 
 		 537 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3565  IS4 family transposase  21.46 
 
 		 537 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050824 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3655  IS4 family transposase  21.46 
 
 		 537 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.338356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2378  iron-containing alcohol dehydrogenase  21.46 
 
 		 537 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0257952  normal  0.284772 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2325  IS4 family transposase  21.46 
 
 		 537 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.366195  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2191  IS4 family transposase  21.46 
 
 		 537 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.694386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0815  IS4 family transposase  21.46 
 
 		 537 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0472  IS4 family transposase  21.46 
 
 		 537 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2638  transposase, IS4 family protein  21.88 
 
 		 563 aa  45.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5959  hypothetical protein  22.56 
 
 		 171 aa  45.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1666  transposase IS4 family protein  24.44 
 
 		 548 aa  44.3  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.475975  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3413  Transposase-like protein  19.61 
 
 		 603 aa  44.3  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.44774  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>