140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00174 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0472  IS4 family transposase  63.62 
 
 
537 aa  721    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0815  IS4 family transposase  63.62 
 
 
537 aa  721    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2191  IS4 family transposase  63.62 
 
 
537 aa  721    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.694386  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2325  IS4 family transposase  63.62 
 
 
537 aa  721    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.366195  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2378  iron-containing alcohol dehydrogenase  63.62 
 
 
537 aa  721    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0257952  normal  0.284772 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2639  IS4 family transposase  63.62 
 
 
537 aa  721    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.110889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2846  IS4 family transposase  63.62 
 
 
537 aa  721    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3565  IS4 family transposase  63.62 
 
 
537 aa  721    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.050824 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3655  IS4 family transposase  63.62 
 
 
537 aa  721    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.338356  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00174  Transposase, IS4 family protein  100 
 
 
544 aa  1140    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02905  Transposase, IS4 family protein  100 
 
 
544 aa  1140    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0683  hypothetical protein  37.1 
 
 
541 aa  350  3e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1039  transposase  36.87 
 
 
534 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.301792  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1188  transposase  36.87 
 
 
534 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1600  transposase  36.87 
 
 
534 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0355  transposase  35.99 
 
 
545 aa  316  7e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2940  hypothetical protein  35.33 
 
 
536 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0019616  hitchhiker  0.00741798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1108  hypothetical protein  35.2 
 
 
536 aa  309  9e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3373  hypothetical protein  35.2 
 
 
536 aa  309  9e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0219057  decreased coverage  0.00537819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1742  transposase  35.06 
 
 
531 aa  306  6e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12588  normal  0.422526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3656  transposase  35.06 
 
 
531 aa  306  6e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.36895  normal  0.0449577 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1188  hypothetical protein  34.73 
 
 
539 aa  302  1e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.199037 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2711  hypothetical protein  34.62 
 
 
539 aa  301  2e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2780  hypothetical protein  34.62 
 
 
539 aa  301  2e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.658994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3116  hypothetical protein  35.55 
 
 
507 aa  298  2e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0767558  hitchhiker  0.00157639 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1191  hypothetical protein  35.49 
 
 
534 aa  297  4e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2697  hypothetical protein  34.81 
 
 
462 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00665146  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1903  transposase  34.91 
 
 
417 aa  236  7e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2827  hypothetical protein  31.89 
 
 
374 aa  194  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1432  transposase family protein  27.12 
 
 
560 aa  179  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2229  transposase family protein  27.12 
 
 
560 aa  179  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000971975 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1862  transposase (IS4 family protein)  27.26 
 
 
560 aa  178  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0324355  normal  0.381496 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0838  transposase (IS4 family protein)  27.26 
 
 
560 aa  178  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0232  transposase (IS4 family protein)  27.26 
 
 
560 aa  178  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1547  transposase family protein  26.94 
 
 
560 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000707148 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0248  transposase  26.87 
 
 
552 aa  171  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0574  transposase  26.87 
 
 
552 aa  171  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0976  transposase  26.87 
 
 
552 aa  171  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2953  transposase  26.87 
 
 
552 aa  171  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00221039  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3055  transposase  26.87 
 
 
552 aa  171  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1078  transposase  26.9 
 
 
552 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1351  transposase  27.1 
 
 
552 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1808  transposase  27.1 
 
 
552 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1923  transposase  27.1 
 
 
552 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0335  transposase  27.1 
 
 
552 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1400  transposase  27.1 
 
 
552 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0181  transposase  27.1 
 
 
552 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2717  transposase  27.31 
 
 
552 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3103  transposase  27.45 
 
 
552 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000596563  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2935  transposase  27.1 
 
 
552 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0309  transposase  27.1 
 
 
552 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1514  transposase  27.26 
 
 
552 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1446  transposase  26.28 
 
 
552 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0521  transposase IS4 family protein  27 
 
 
560 aa  155  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0714  transposase IS4 family protein  27 
 
 
560 aa  155  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.799993  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1060  transposase IS4 family protein  27 
 
 
560 aa  155  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807902  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1497  transposase IS4 family protein  27 
 
 
560 aa  155  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00603607  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1510  transposase IS4 family protein  27 
 
 
560 aa  155  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.03574  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2034  transposase IS4 family protein  27 
 
 
560 aa  155  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121985  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2556  transposase IS4 family protein  27 
 
 
560 aa  155  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2698  hypothetical protein  34.98 
 
 
272 aa  138  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000472766  normal  0.109857 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3280  hypothetical protein  34.09 
 
 
400 aa  134  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.338919 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1724  transposase  25.84 
 
 
402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000337952  normal  0.570095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2655  Transposase-like protein  26.02 
 
 
572 aa  92.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000825178  hitchhiker  0.000880937 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2599  Transposase-like protein  26.02 
 
 
572 aa  92.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0014621  hitchhiker  0.00315574 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5390  transposase  28.8 
 
 
537 aa  80.9  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6275  transposase  28.8 
 
 
537 aa  80.9  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.584327  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0475  transposase  28.57 
 
 
538 aa  77.8  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1312  transposase  28.57 
 
 
538 aa  77.8  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1592  transposase  28.57 
 
 
538 aa  77.8  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.010832  normal  0.156846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2536  transposase  28.57 
 
 
538 aa  77.8  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.58057  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2854  transposase  28.57 
 
 
538 aa  77.8  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4811  transposase  28.57 
 
 
538 aa  77.8  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4642  hypothetical protein  38.27 
 
 
93 aa  74.7  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187996  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2373  transposase  53.45 
 
 
71 aa  67.8  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.226178 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0383  transposase IS4 family protein  22.92 
 
 
604 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0558  transposase  26.54 
 
 
449 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  24.39 
 
 
561 aa  61.6  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0511  Transposase-like protein  23.17 
 
 
604 aa  61.6  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.638889 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3806  Transposase-like protein  23.17 
 
 
604 aa  61.6  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2852  transposase  21.73 
 
 
574 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  22.15 
 
 
596 aa  59.3  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  22.15 
 
 
596 aa  58.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  21.98 
 
 
596 aa  57.8  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0274  transposase, IS4  28.47 
 
 
577 aa  57.8  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0266253 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0555  transposase, IS4  28.47 
 
 
577 aa  57.8  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218237  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0662  transposase, IS4  28.47 
 
 
577 aa  57.8  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.45614  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1070  transposase, IS4  28.47 
 
 
577 aa  57.8  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0734181  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2539  transposase, IS4  28.47 
 
 
577 aa  57.8  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.288915 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3134  transposase, IS4  28.47 
 
 
577 aa  57.8  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  hitchhiker  0.00132337 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1783  transposase  21.35 
 
 
574 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0958  transposase  24.65 
 
 
578 aa  54.3  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0721  transposase  24.36 
 
 
578 aa  53.5  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1955  transposase  24.85 
 
 
578 aa  53.5  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5319  hypothetical protein  34.04 
 
 
126 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283015  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3021  hypothetical protein  27.01 
 
 
371 aa  52  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1552  transposase IS4 family protein  37.38 
 
 
558 aa  51.6  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3060  transposase IS4 family protein  32.47 
 
 
579 aa  51.6  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1216  hypothetical protein  39.39 
 
 
70 aa  51.2  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.243751  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3900  transposase IS4 family protein  19.8 
 
 
587 aa  50.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.44467 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>