More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0124 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0124  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 401 aa  825    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3479  tryptophan synthase subunit beta  66.75 
 
 		 387 aa  498  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1588  tryptophan synthase subunit beta  64.25 
 
 		 396 aa  499  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00363039  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1741  tryptophan synthase subunit beta  65.21 
 
 		 394 aa  496  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1535  tryptophan synthase subunit beta  62.3 
 
 		 390 aa  489  1e-137  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.442793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2467  tryptophan synthase subunit beta  63.09 
 
 		 395 aa  486  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  59.02 
 
 		 409 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  57.77 
 
 		 399 aa  460  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  58.81 
 
 		 404 aa  457  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  56.99 
 
 		 399 aa  455  1e-127  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  58.27 
 
 		 409 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  56.74 
 
 		 399 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  57.59 
 
 		 391 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  58.42 
 
 		 405 aa  449  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  56.85 
 
 		 397 aa  450  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  57.58 
 
 		 403 aa  451  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  56.85 
 
 		 397 aa  448  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  57.54 
 
 		 402 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  57.4 
 
 		 396 aa  448  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  56.85 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  56.59 
 
 		 397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  56.59 
 
 		 397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  56.59 
 
 		 397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  56.59 
 
 		 397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  56.59 
 
 		 397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  56.33 
 
 		 397 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32688  predicted protein  57.22 
 
 		 417 aa  444  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0289228  normal  0.0344017 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0166  tryptophan synthase subunit beta  55.58 
 
 		 414 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0594261  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  57.03 
 
 		 399 aa  442  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  57.8 
 
 		 404 aa  442  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0810  tryptophan synthase subunit beta  57.54 
 
 		 389 aa  442  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  56.67 
 
 		 396 aa  443  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0581  tryptophan synthase subunit beta  55.19 
 
 		 409 aa  443  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  57.03 
 
 		 399 aa  442  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  56.35 
 
 		 401 aa  442  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  57.54 
 
 		 389 aa  442  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  56.12 
 
 		 397 aa  442  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  57.37 
 
 		 394 aa  442  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  54.59 
 
 		 394 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  55.1 
 
 		 397 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01821  tryptophan synthase subunit beta  55.06 
 
 		 414 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  55.44 
 
 		 413 aa  440  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0113  tryptophan synthase subunit beta  57.14 
 
 		 399 aa  439  9.999999999999999e-123  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  56.67 
 
 		 396 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2272  tryptophan synthase subunit beta  56.03 
 
 		 413 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0535171 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1771  tryptophan synthase subunit beta  57.47 
 
 		 410 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  58.63 
 
 		 395 aa  435  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01841  tryptophan synthase subunit beta  55.06 
 
 		 414 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01811  tryptophan synthase subunit beta  54.87 
 
 		 416 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0720607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  55.05 
 
 		 413 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1531  tryptophan synthase subunit beta  55.1 
 
 		 417 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.636717  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2511  tryptophan synthase subunit beta  56.41 
 
 		 413 aa  437  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  55.22 
 
 		 401 aa  435  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2143  tryptophan synthase subunit beta  55.44 
 
 		 420 aa  437  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0206171  normal  0.237473 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  54.25 
 
 		 403 aa  435  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0108  tryptophan synthase subunit beta  58.59 
 
 		 393 aa  435  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  54.33 
 
 		 394 aa  436  1e-121  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  55.36 
 
 		 415 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02381  tryptophan synthase subunit beta  55.05 
 
 		 417 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  56.52 
 
 		 411 aa  435  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  55.05 
 
 		 413 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1691  tryptophan synthase subunit beta  55.61 
 
 		 393 aa  432  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  56.88 
 
 		 396 aa  434  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0870  tryptophan synthase subunit beta  56.46 
 
 		 399 aa  432  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318108 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  56.27 
 
 		 394 aa  433  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  56.78 
 
 		 412 aa  434  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  55.5 
 
 		 408 aa  433  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  54.07 
 
 		 394 aa  432  1e-120  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  53.33 
 
 		 414 aa  432  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01931  tryptophan synthase subunit beta  54.55 
 
 		 414 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  53.81 
 
 		 394 aa  432  1e-120  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4724  tryptophan synthase subunit beta  54.87 
 
 		 411 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  56.52 
 
 		 397 aa  431  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  55.61 
 
 		 397 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3622  tryptophan synthase subunit beta  56.77 
 
 		 426 aa  431  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  58.35 
 
 		 402 aa  428  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1912  tryptophan synthase subunit beta  55.56 
 
 		 398 aa  429  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0755  tryptophan synthase subunit beta  55.47 
 
 		 415 aa  431  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000954006  normal  0.692308 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  56.44 
 
 		 400 aa  428  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  56.38 
 
 		 397 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  54.8 
 
 		 403 aa  431  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  56.15 
 
 		 397 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  56.15 
 
 		 397 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5243  tryptophan synthase subunit beta  54.43 
 
 		 418 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  54.29 
 
 		 405 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  54.29 
 
 		 405 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  55.58 
 
 		 402 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  55.47 
 
 		 399 aa  426  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  56.12 
 
 		 397 aa  425  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  55.67 
 
 		 397 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1415  tryptophan synthase subunit beta  53.32 
 
 		 425 aa  425  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  55.64 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3616  tryptophan synthase subunit beta  55.1 
 
 		 447 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  56.63 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  55.67 
 
 		 397 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1215  tryptophan synthase subunit beta  54.29 
 
 		 422 aa  425  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0236312 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0223  tryptophan synthase subunit beta  57.7 
 
 		 388 aa  428  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  54.34 
 
 		 402 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1321  tryptophan synthase subunit beta  56.95 
 
 		 373 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000135158 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2139  tryptophan synthase subunit beta  55.53 
 
 		 404 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>