More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0102 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
289 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  45.8 
 
 
297 aa  225  5.0000000000000005e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  43.36 
 
 
294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  44.49 
 
 
288 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.66 
 
 
323 aa  202  5e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  43.06 
 
 
294 aa  193  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.02 
 
 
300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  29.49 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.85 
 
 
309 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  33.22 
 
 
312 aa  107  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  30.85 
 
 
317 aa  107  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.82 
 
 
317 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.7 
 
 
310 aa  102  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0320  hypothetical protein  28.27 
 
 
310 aa  93.6  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  30.3 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.06 
 
 
310 aa  86.7  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  30.88 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.63 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.43 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  27.03 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  31.4 
 
 
317 aa  78.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  26.32 
 
 
315 aa  75.5  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1515  hypothetical protein  26.62 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.910638  normal  0.799854 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  25 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  24.44 
 
 
327 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.51 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0742  hypothetical protein  28.87 
 
 
314 aa  72.4  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456676  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  27.8 
 
 
308 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1436  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.72 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.397565  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.09 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0494  DMT family permease  23.51 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  30.39 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  29.67 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1646  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.64 
 
 
315 aa  68.9  0.00000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.42 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  30.61 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  27.39 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0416  hypothetical protein  29.49 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.848373  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.92 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324691  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  29.17 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0495  hypothetical protein  23.65 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  29.82 
 
 
305 aa  67  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  30.22 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0645  EamA family protein  22.97 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  29.17 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0619  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.57 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.8 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.138345  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  27.45 
 
 
331 aa  65.1  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  27.72 
 
 
286 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.36 
 
 
289 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0550  EamA family protein  22.33 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0581  eama family protein  22.33 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  29.58 
 
 
316 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  24.9 
 
 
300 aa  64.7  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.67 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4720  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.31 
 
 
308 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  29.51 
 
 
309 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1412  hypothetical protein  21.54 
 
 
322 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0003  hypothetical protein  24.91 
 
 
288 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0492  DMT family permease  22.33 
 
 
308 aa  62.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.348836  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.82 
 
 
315 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  29.17 
 
 
309 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  29.12 
 
 
397 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 
287 aa  62.4  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0707  transporter, EamA family  22.18 
 
 
308 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.71 
 
 
278 aa  62.4  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  31.67 
 
 
302 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 
321 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.69 
 
 
293 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0149413 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  28.81 
 
 
298 aa  62  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  29.17 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  28.21 
 
 
292 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03168  permease of the drug/metabolite transporter  26.41 
 
 
347 aa  61.6  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11064  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  29.17 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  25.09 
 
 
303 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0614  hypothetical protein  24.81 
 
 
293 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  29.82 
 
 
321 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0947  integral membrane protein  23.24 
 
 
290 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114087  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.45 
 
 
303 aa  61.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000007978  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.16 
 
 
311 aa  61.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0876  integral membrane protein  22.89 
 
 
290 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00907858  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0911  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.45 
 
 
294 aa  61.6  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0168694  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.34 
 
 
311 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  21.5 
 
 
322 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  27.35 
 
 
293 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.09 
 
 
301 aa  60.8  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1777  transporter  26.57 
 
 
296 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0438  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.91 
 
 
316 aa  60.1  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  32.42 
 
 
402 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  23.67 
 
 
302 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  23.67 
 
 
302 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27.45 
 
 
299 aa  59.7  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  25.61 
 
 
294 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  25.61 
 
 
294 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.88 
 
 
282 aa  59.3  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3346  hypothetical protein  25.76 
 
 
331 aa  59.3  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26320  predicted permease, DMT superfamily  24.36 
 
 
319 aa  59.3  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3359  hypothetical protein  27.97 
 
 
311 aa  59.3  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  27.18 
 
 
308 aa  58.9  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.95 
 
 
325 aa  58.9  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>