244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3318 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  100 
 
 
282 aa  566  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  49.29 
 
 
281 aa  305  4.0000000000000004e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  53.26 
 
 
293 aa  297  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  51.07 
 
 
284 aa  282  4.0000000000000003e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2832  degV family protein  44.04 
 
 
281 aa  242  5e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2518  degV family protein  43.32 
 
 
281 aa  239  5e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  39.07 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1941  degV family protein  34.89 
 
 
284 aa  198  7.999999999999999e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.676322  normal  0.0830662 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0942  hypothetical protein  38.65 
 
 
285 aa  195  9e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  36.65 
 
 
282 aa  182  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  36.36 
 
 
282 aa  170  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  35.25 
 
 
287 aa  170  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  34.38 
 
 
299 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  38.89 
 
 
280 aa  166  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  37.81 
 
 
280 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  36.17 
 
 
286 aa  165  9e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  34.04 
 
 
284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  38.52 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  38.16 
 
 
280 aa  162  7e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  38.16 
 
 
280 aa  162  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1102  degV family protein  34.75 
 
 
285 aa  162  7e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  38.03 
 
 
280 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  38.16 
 
 
287 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  38.16 
 
 
287 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  37.81 
 
 
280 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  38.52 
 
 
280 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  38.99 
 
 
286 aa  159  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  38.27 
 
 
286 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  38.63 
 
 
286 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  38.27 
 
 
286 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  38.27 
 
 
286 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  38.27 
 
 
286 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  38.27 
 
 
286 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  35.23 
 
 
283 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  35.23 
 
 
283 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  37.89 
 
 
282 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  37.89 
 
 
282 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  38.27 
 
 
286 aa  155  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1342  DegV family protein  32.01 
 
 
282 aa  152  5e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  35.13 
 
 
282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  37.55 
 
 
286 aa  152  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  30.99 
 
 
637 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  32.98 
 
 
287 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  34.06 
 
 
281 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  37.18 
 
 
286 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  32.62 
 
 
281 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2272  hypothetical protein  34.75 
 
 
282 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12580  degV family protein  33.45 
 
 
284 aa  149  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0600  degV family protein  31.43 
 
 
683 aa  148  9e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100467 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  31.18 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  32.62 
 
 
287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  31.21 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  33.1 
 
 
292 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  32.61 
 
 
296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  32.06 
 
 
291 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1644  degV family protein  31.93 
 
 
604 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.524877  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  34.16 
 
 
282 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  32.98 
 
 
279 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  34.06 
 
 
280 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  32.4 
 
 
283 aa  143  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  32.98 
 
 
279 aa  143  4e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  32.98 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  35.36 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  33.1 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  32.62 
 
 
290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  31.36 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  32.62 
 
 
293 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  34.15 
 
 
279 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  34.15 
 
 
279 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  33.69 
 
 
280 aa  139  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  33.22 
 
 
310 aa  139  6e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  29.96 
 
 
271 aa  139  7e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  31.05 
 
 
283 aa  139  7e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1885  degV family protein  31.1 
 
 
284 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0416  DegV family protein  31.48 
 
 
288 aa  137  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  32.97 
 
 
280 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  32.97 
 
 
280 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  32.03 
 
 
279 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0030  degV family protein  32.06 
 
 
291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  33.69 
 
 
282 aa  135  7.000000000000001e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  32.98 
 
 
311 aa  135  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1346  degV family protein  29.37 
 
 
285 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000423289  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  31.4 
 
 
312 aa  135  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  32.01 
 
 
280 aa  135  8e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1267  degV family protein  33.92 
 
 
311 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  33.33 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3526  degV family protein  28.88 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  31.23 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3599  degV family protein  28.88 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3531  degV family protein  28.88 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.766898 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  32.62 
 
 
280 aa  133  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  32.62 
 
 
280 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5472  degV family protein  33.1 
 
 
326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  31.32 
 
 
279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  32.26 
 
 
280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  32.26 
 
 
280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  32.26 
 
 
280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  30.94 
 
 
280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3275  degV family protein  30.74 
 
 
292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632597  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  32.26 
 
 
280 aa  132  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>