More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1971 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1971  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  697    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3205  sporulation integral membrane protein YtvI  46.56 
 
 		 362 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000954806  hitchhiker  0.000000642415 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0614  hypothetical protein  39.71 
 
 		 358 aa  257  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0888  hypothetical protein  35 
 
 		 370 aa  216  5e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000401846  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0585  sporulation integral membrane protein YtvI  40.97 
 
 		 351 aa  202  7e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1040  hypothetical protein  34.48 
 
 		 366 aa  196  4.0000000000000005e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00428171  unclonable  0.0000000129007 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2683  sporulation integral membrane protein YtvI  35.03 
 
 		 372 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0571053  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3372  sporulation integral membrane protein YtvI  31.78 
 
 		 353 aa  188  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3280  sporulation integral membrane protein YtvI  34.63 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4490  hypothetical protein  34.76 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0811913  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4841  hypothetical protein  34.76 
 
 		 365 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4727  hypothetical protein  34.76 
 
 		 365 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07720  Sporulation integral membrane protein YtvI  34.15 
 
 		 355 aa  179  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4711  sporulation integral membrane protein YtvI  34.76 
 
 		 372 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000506038 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4325  permease  34.76 
 
 		 372 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4337  permease  34.76 
 
 		 372 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4722  sporulation integral membrane protein YtvI  34.76 
 
 		 372 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4706  sporulation integral membrane protein YtvI  34.76 
 
 		 372 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0531  sporulation integral membrane protein YtvI  34.76 
 
 		 372 aa  179  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.671743 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4426  sporulation integral membrane protein YtvI  34.45 
 
 		 372 aa  171  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0024  hypothetical protein  32.85 
 
 		 355 aa  169  9e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1013  hypothetical protein  32.29 
 
 		 360 aa  168  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000395023  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0985  sporulation integral membrane protein YtvI  30.72 
 
 		 341 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0779  sporulation integral membrane protein YtvI  34.28 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2924  sporulation integral membrane protein YtvI  30.26 
 
 		 354 aa  161  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000157456  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2429  hypothetical protein  27.97 
 
 		 356 aa  157  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0429  sporulation integral membrane protein YtvI  29.23 
 
 		 375 aa  155  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0189  sporulation integral membrane protein YtvI  28.04 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2466  sporulation integral membrane protein YtvI  32.4 
 
 		 343 aa  146  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.180742  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3703  sporulation integral membrane protein YtvI  30.45 
 
 		 365 aa  142  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000243637  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0427  sporulation integral membrane protein YtvI  29.79 
 
 		 371 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3838  sporulation integral membrane protein YtvI  25.86 
 
 		 344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000542228  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3488  sporulation integral membrane protein YtvI  29.47 
 
 		 374 aa  117  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000381599  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  28.23 
 
 		 341 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0115  sporulation integral membrane protein YtvI  25.4 
 
 		 356 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00027098  hitchhiker  0.00391046 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2662  sporulation integral membrane protein YtvI  28.62 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0628  sporulation integral membrane protein YtvI  26.89 
 
 		 367 aa  100  6e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  25.79 
 
 		 354 aa  92.4  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  26.71 
 
 		 361 aa  92.8  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  27.27 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  26.39 
 
 		 361 aa  90.9  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  26.3 
 
 		 351 aa  90.9  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  27.61 
 
 		 353 aa  90.5  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  26.73 
 
 		 344 aa  90.1  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1173  protein of unknown function UPF0118  27.38 
 
 		 386 aa  89.4  9e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  24.38 
 
 		 343 aa  89.4  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  25.85 
 
 		 388 aa  89  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  27.02 
 
 		 361 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  27.02 
 
 		 361 aa  87.4  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  23.31 
 
 		 349 aa  87  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  27.02 
 
 		 361 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  27.27 
 
 		 348 aa  86.7  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  26.72 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  26.72 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  24.38 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  26.88 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  24.38 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  24.38 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  24.38 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  24.38 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  26.48 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0262  hypothetical protein  26.17 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00766044 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1639  hypothetical protein  25.62 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  24.38 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  26.72 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  26.56 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0574  hypothetical protein  27.04 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.877456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  24.06 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  24.06 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  24.46 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  23.1 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  22.68 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  24.69 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  23.92 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  23.23 
 
 		 345 aa  77.8  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  26.25 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  24.68 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  23.51 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0554  hypothetical protein  26.05 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  23.42 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  22.92 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1113  hypothetical protein  26.98 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0939063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  23.89 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  24.49 
 
 		 356 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  25.54 
 
 		 367 aa  72.8  0.000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  22.64 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  23.82 
 
 		 452 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  21.43 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  21.43 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  27.97 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  22.09 
 
 		 368 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2984  sporulation integral membrane protein YtvI  27.53 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0568  hypothetical protein  26.03 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1671  hypothetical protein  26.98 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  26.05 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  25.08 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  23.89 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  22.36 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0111  permease  26.35 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  26.23 
 
 		 436 aa  69.3  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>