More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1923 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0841  vesicle-fusing ATPase  65.72 
 
 
491 aa  664    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.362889  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1923  vesicle-fusing ATPase  100 
 
 
494 aa  1004    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.385338  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3106  Adenosinetriphosphatase  65.38 
 
 
493 aa  674    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000310536  normal  0.727853 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0625  Vesicle-fusing ATPase  61.59 
 
 
500 aa  632  1e-180  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1077  vesicle-fusing ATPase  58.91 
 
 
494 aa  592  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11930  Microtubule-severing ATPase  55.71 
 
 
490 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000271723  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0078  microtubule-severing ATPase  55.31 
 
 
490 aa  553  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3121  Microtubule-severing ATPase  54.75 
 
 
493 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1258  vesicle-fusing ATPase  56.81 
 
 
493 aa  540  9.999999999999999e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.3081  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1639  Vesicle-fusing ATPase  53.64 
 
 
503 aa  535  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1470  AAA ATPase central domain protein  48.99 
 
 
494 aa  489  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.043509  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1606  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.8 
 
 
660 aa  339  8e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0276  ATP-dependent Zn protease  44.47 
 
 
708 aa  338  9.999999999999999e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00629107  normal  0.162688 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1034  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.86 
 
 
510 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.79 
 
 
610 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.2 
 
 
614 aa  336  5e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.58 
 
 
610 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.36 
 
 
607 aa  333  4e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.4 
 
 
653 aa  332  1e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  39.11 
 
 
783 aa  329  6e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.2 
 
 
697 aa  328  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.2 
 
 
697 aa  328  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.98 
 
 
624 aa  327  3e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.565531  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.33 
 
 
633 aa  327  4.0000000000000003e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33311  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  41.89 
 
 
700 aa  325  1e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1180  cell division protein FtsH  41.24 
 
 
617 aa  324  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334987  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.36 
 
 
750 aa  323  3e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.08 
 
 
639 aa  324  3e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.58 
 
 
605 aa  323  4e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.365345 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1168  FtsH-2 peptidase  45.58 
 
 
605 aa  323  5e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.747317  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.96 
 
 
602 aa  323  5e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1784  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.92 
 
 
660 aa  322  7e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0518301 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1774  FtsH-2 peptidase  43.62 
 
 
702 aa  322  8e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.517267  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  40 
 
 
630 aa  322  9.000000000000001e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2104  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.25 
 
 
677 aa  321  9.999999999999999e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.2 
 
 
714 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.09 
 
 
617 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3415  FtsH-2 peptidase  45.81 
 
 
627 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.2 
 
 
696 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.24 
 
 
682 aa  320  3e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0172  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.54 
 
 
646 aa  320  3e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  43.6 
 
 
637 aa  320  3e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.84 
 
 
646 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  40.37 
 
 
635 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.37 
 
 
635 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.84 
 
 
646 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.63 
 
 
630 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  44.16 
 
 
684 aa  319  6e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.37 
 
 
635 aa  319  7.999999999999999e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2158  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.85 
 
 
706 aa  318  9e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39 
 
 
611 aa  319  9e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2066  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.85 
 
 
705 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5357  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  44.55 
 
 
615 aa  318  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0232294 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.43 
 
 
634 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0326  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.43 
 
 
681 aa  317  3e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000432409  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  37.6 
 
 
759 aa  317  3e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1229  cell division protein  40.99 
 
 
646 aa  317  4e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  39.84 
 
 
602 aa  317  4e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  39.88 
 
 
614 aa  316  5e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  45.13 
 
 
627 aa  316  5e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.61 
 
 
635 aa  316  6e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.13 
 
 
651 aa  316  6e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  41.01 
 
 
633 aa  316  7e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  40.2 
 
 
608 aa  315  8e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0014  cell division protein  41.19 
 
 
655 aa  315  8e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0538  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.93 
 
 
659 aa  315  9e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673684  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.04 
 
 
612 aa  315  9e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.39 
 
 
632 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1495  FtsH-2 peptidase  42.12 
 
 
635 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.421707  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2043  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.89 
 
 
687 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000823852 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0873  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.21 
 
 
645 aa  315  9.999999999999999e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0168176  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  37.92 
 
 
645 aa  315  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08270  ATP-dependent metallopeptidase M41, FtsH  47.91 
 
 
616 aa  315  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.24 
 
 
612 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.18 
 
 
612 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4465  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.85 
 
 
610 aa  315  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  41.01 
 
 
633 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  41.01 
 
 
633 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  41.01 
 
 
633 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  41.79 
 
 
613 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  41.01 
 
 
633 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.84 
 
 
643 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  41.01 
 
 
633 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  41.01 
 
 
633 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4825  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.28 
 
 
610 aa  315  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185194  normal  0.513387 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24780  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.21 
 
 
698 aa  314  2.9999999999999996e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2393  FtsH peptidase  39.7 
 
 
619 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00023499  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  43.14 
 
 
639 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0518  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.83 
 
 
636 aa  314  2.9999999999999996e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000475149  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0193  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.98 
 
 
607 aa  314  2.9999999999999996e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.14 
 
 
639 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.77 
 
 
608 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.74 
 
 
604 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  39.11 
 
 
499 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  39.6 
 
 
613 aa  313  3.9999999999999997e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  38.99 
 
 
640 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4374  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.57 
 
 
618 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.83 
 
 
753 aa  313  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.43 
 
 
639 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  42.49 
 
 
646 aa  312  6.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>