266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1047 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1047  peptidase A24A domain-containing protein  100 
 
 
248 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424569  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  51.43 
 
 
250 aa  255  5e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0967  peptidase A24A domain-containing protein  57.02 
 
 
254 aa  241  6e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0417155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  52.24 
 
 
248 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  50.79 
 
 
259 aa  223  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  46.28 
 
 
247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  48.75 
 
 
263 aa  204  8e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  47.18 
 
 
259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1508  peptidase A24A domain-containing protein  42.97 
 
 
252 aa  193  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000599925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  45.98 
 
 
274 aa  193  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  45.17 
 
 
274 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1715  peptidase A24A domain protein  50 
 
 
250 aa  188  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  44.4 
 
 
281 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  43.32 
 
 
259 aa  186  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  47.58 
 
 
261 aa  185  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2571  Type IV leader peptidase family protein  40.82 
 
 
247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2273  signal peptidase type IV  41.22 
 
 
247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  43.33 
 
 
254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  41.91 
 
 
246 aa  172  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  43.55 
 
 
255 aa  169  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2557  peptidase A24A domain protein  40.42 
 
 
248 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  40.23 
 
 
259 aa  163  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  36.05 
 
 
265 aa  161  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  39.84 
 
 
275 aa  160  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  41.6 
 
 
258 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2683  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.85 
 
 
273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2819  peptidase A24A domain-containing protein  39.43 
 
 
251 aa  153  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000194344  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  40.41 
 
 
260 aa  152  2.9999999999999998e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0310  prepilin peptidase  37.5 
 
 
288 aa  152  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  37.09 
 
 
289 aa  152  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  37.09 
 
 
283 aa  152  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0538  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  45.65 
 
 
250 aa  150  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  39.59 
 
 
253 aa  148  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  35.64 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  35.27 
 
 
291 aa  146  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2985  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.08 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.749856 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  36.89 
 
 
266 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  36.89 
 
 
266 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1801  peptidase A24A domain-containing protein  39.36 
 
 
267 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.576594 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0892  peptidase A24A domain protein  41.28 
 
 
251 aa  145  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1027  peptidase A24A domain-containing protein  36.97 
 
 
240 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.773434  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  39.25 
 
 
293 aa  144  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  35.17 
 
 
304 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  34.91 
 
 
290 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4659  peptidase A24A domain protein  36.8 
 
 
270 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165962 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0214  peptidase A24A domain-containing protein  36.95 
 
 
263 aa  142  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.156269  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0199  Prepilin peptidase  39.27 
 
 
270 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0204  peptidase A24A domain protein  39.27 
 
 
270 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  35.17 
 
 
308 aa  141  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  35.63 
 
 
255 aa  140  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  35.69 
 
 
287 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  34.13 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03233  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  34.04 
 
 
297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0166212  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  34.75 
 
 
308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  34.75 
 
 
304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  37.45 
 
 
300 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0996  peptidase A24A-like  36.4 
 
 
271 aa  139  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1879  peptidase A24A domain protein  35.54 
 
 
258 aa  139  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.240365  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2094  leader peptidase PilD  36.82 
 
 
289 aa  138  7e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3131  peptidase A24A domain protein  36.73 
 
 
260 aa  137  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  38.78 
 
 
263 aa  137  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3425  prepilin peptidase  37.71 
 
 
308 aa  137  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195496  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1502  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  36.03 
 
 
287 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0062  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.02 
 
 
299 aa  137  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282125  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  37.25 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  35.29 
 
 
287 aa  135  5e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  38.82 
 
 
308 aa  135  8e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1581  Prepilin peptidase  35.47 
 
 
294 aa  135  9e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  36.59 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.82 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.82 
 
 
308 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1037  peptidase A24A domain protein  36.1 
 
 
267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.869777 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0970  prepilin peptidase  36.68 
 
 
273 aa  132  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  34.94 
 
 
288 aa  132  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5164  type 4 prepilin peptidase PilD  33.69 
 
 
290 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0773  prepilin peptidase  36.96 
 
 
289 aa  132  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.02 
 
 
308 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  33.82 
 
 
289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2707  Prepilin peptidase  33.72 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  34.35 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  34.53 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0861  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.29 
 
 
298 aa  130  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.19 
 
 
288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1173  peptidase A24A domain-containing protein  36.51 
 
 
244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000679312  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0021  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.02 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  33.47 
 
 
308 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4822  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.42 
 
 
290 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.823452  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  35.23 
 
 
296 aa  128  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2409  Prepilin peptidase  37.76 
 
 
257 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0391481 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58770  type 4 prepilin peptidase PilD  33.33 
 
 
290 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.896389  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  35.25 
 
 
283 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2579  peptidase A24A domain protein  36.32 
 
 
239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.691194 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0971  peptidase A24 N- domain-containing protein  34.41 
 
 
253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436062  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1117  peptidase A24A domain protein  35.71 
 
 
278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2029  peptidase A24A domain-containing protein  37.93 
 
 
287 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250506  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2107  prepilin peptidase  37.93 
 
 
287 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  33.82 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  32.23 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  32.36 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  32.6 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0406181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>