69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2689 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2689  SH3 type 3 domain-containing protein  100 
 
 		 676 aa  1372    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1940  SH3 type 3 domain-containing protein  39.05 
 
 		 522 aa  107  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  42.86 
 
 		 773 aa  105  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1315  hypothetical protein  23.3 
 
 		 455 aa  87  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.538272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0368  hypothetical protein  24.94 
 
 		 570 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1178  hypothetical protein  22.75 
 
 		 425 aa  81.6  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2970  hypothetical protein  27.15 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2785  hypothetical protein  27.15 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2392  hypothetical protein  23.95 
 
 		 453 aa  80.9  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.514356  normal  0.55434 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  29.14 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0807  hypothetical protein  21.15 
 
 		 441 aa  72.4  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.96 
 
 		 553 aa  71.2  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.369962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2423  SH3 type 3 domain-containing protein  40.22 
 
 		 682 aa  69.7  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000143632  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2226  hypothetical protein  23.5 
 
 		 602 aa  67.8  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2011  hypothetical protein  23.21 
 
 		 490 aa  64.3  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3284  hypothetical protein  23.46 
 
 		 475 aa  60.1  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2269  putative cox2 cytochrome oxidase subunit 2  44.44 
 
 		 677 aa  58.5  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2546  putative cox2 cytochrome oxidase subunit 2  44.44 
 
 		 677 aa  58.2  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00554628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4690  transcriptional regulator LysR  29.27 
 
 		 527 aa  57.4  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.989962  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3777  putative cox2 cytochrome oxidase subunit 2  42.47 
 
 		 657 aa  57  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000560662  hitchhiker  0.00392281 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1660  hypothetical protein  29.71 
 
 		 415 aa  56.2  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  29.22 
 
 		 564 aa  55.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1903  M23/37 family peptidase  29.22 
 
 		 564 aa  54.3  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000402629  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1511  hypothetical protein  27.81 
 
 		 524 aa  53.9  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  29.22 
 
 		 564 aa  54.3  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1245  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  25.85 
 
 		 969 aa  52.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0232944  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2693  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.23 
 
 		 616 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17431  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  30.23 
 
 		 391 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1938  peptidase, M23/M37 family  28.57 
 
 		 564 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2868799999999999e-45 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2466  putative regulatory protein, LysR  28.98 
 
 		 512 aa  51.2  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  34.29 
 
 		 235 aa  51.2  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  28.78 
 
 		 556 aa  51.2  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3063  peptidase M23B  24.39 
 
 		 377 aa  50.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000502081  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.46 
 
 		 1776 aa  49.7  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0610  peptidase M23B  26.85 
 
 		 383 aa  49.7  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000136568  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  27.27 
 
 		 536 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0801  peptidase, M23/M37 family  27.69 
 
 		 386 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70657e-48 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0634  peptidase NLP/P60 /M23/M37 peptidase domain-containing protein  27.69 
 
 		 386 aa  48.1  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.2041900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0690  M24/M37 family peptidase  29.23 
 
 		 386 aa  47.8  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000234103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0724  M23/37 family peptidase  29.23 
 
 		 386 aa  47.8  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000754893  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0779  peptidase, M23/M37 family  26.06 
 
 		 384 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0000701566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0634  peptidase NLP/P60 /M23/M37 peptidase domain-containing protein  27.69 
 
 		 386 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000528425  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0477  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.62 
 
 		 377 aa  47.4  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0876  peptidase, M23/M37 family  27.69 
 
 		 386 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4552  peptidase, M23/M37 family  26.06 
 
 		 384 aa  47  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000312233  normal  0.0469454 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0794  M24/M37 family peptidase  27.69 
 
 		 384 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000011526  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3345  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.92 
 
 		 448 aa  47  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1439  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  26.06 
 
 		 1049 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00896108  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3222  hypothetical protein  27.61 
 
 		 516 aa  47.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.258134  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2985  hypothetical protein  21.7 
 
 		 409 aa  47.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4199  SH3, type 3  26.47 
 
 		 459 aa  46.6  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1509  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.17 
 
 		 751 aa  46.2  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0136849  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0118  putative nuclease  31.18 
 
 		 375 aa  45.8  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  24.63 
 
 		 577 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5084  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, C-terminus  23.48 
 
 		 341 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143081  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  24.63 
 
 		 582 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2057  hypothetical protein  27.37 
 
 		 654 aa  45.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3626  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.21 
 
 		 476 aa  45.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000133632  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0211  hypothetical protein  21.72 
 
 		 475 aa  44.7  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.359203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24290  glycine betaine transmethylase  37.04 
 
 		 654 aa  45.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000902449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  24 
 
 		 418 aa  45.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  23.88 
 
 		 582 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  23.88 
 
 		 579 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.88 
 
 		 580 aa  44.3  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1424  hypothetical protein  22.83 
 
 		 445 aa  44.3  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.294946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  23.88 
 
 		 598 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  23.88 
 
 		 582 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  24.84 
 
 		 578 aa  43.9  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3295  hypothetical protein  23.02 
 
 		 158 aa  43.9  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164661 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>