21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0368 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0368  hypothetical protein  100 
 
 
570 aa  1162    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2392  hypothetical protein  56.45 
 
 
453 aa  496  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.514356  normal  0.55434 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3284  hypothetical protein  46.73 
 
 
475 aa  365  1e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0807  hypothetical protein  28.07 
 
 
441 aa  131  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2226  hypothetical protein  24.9 
 
 
602 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1178  hypothetical protein  24.18 
 
 
425 aa  89.4  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3222  hypothetical protein  27.68 
 
 
516 aa  85.9  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.258134  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2689  SH3 type 3 domain-containing protein  24.94 
 
 
676 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2985  hypothetical protein  24.2 
 
 
409 aa  68.2  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0633  hypothetical protein  26.96 
 
 
482 aa  63.2  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.616937 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0960  hypothetical protein  24.13 
 
 
483 aa  58.9  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.364333  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4690  transcriptional regulator LysR  23.54 
 
 
527 aa  57.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.989962  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1514  hypothetical protein  23.89 
 
 
414 aa  57  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0538542  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2785  hypothetical protein  22.53 
 
 
427 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191276  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2742  hypothetical protein  23.78 
 
 
457 aa  48.9  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0211  hypothetical protein  21.1 
 
 
475 aa  49.7  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.359203  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1424  hypothetical protein  20.99 
 
 
445 aa  48.9  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.294946  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2970  hypothetical protein  22.25 
 
 
427 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0153  hypothetical protein  23.89 
 
 
462 aa  47.8  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3777  putative cox2 cytochrome oxidase subunit 2  22.28 
 
 
657 aa  46.6  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000560662  hitchhiker  0.00392281 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1351  transcriptional regulator LysR  22.3 
 
 
549 aa  43.5  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000706303  hitchhiker  0.0000188076 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>