23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3284 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3284  hypothetical protein  100 
 
 
475 aa  953    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0368  hypothetical protein  46.73 
 
 
570 aa  365  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2392  hypothetical protein  43.16 
 
 
453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.514356  normal  0.55434 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2226  hypothetical protein  26.76 
 
 
602 aa  106  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0807  hypothetical protein  26.25 
 
 
441 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1178  hypothetical protein  22.71 
 
 
425 aa  79.7  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2785  hypothetical protein  27.3 
 
 
427 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191276  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2970  hypothetical protein  27.03 
 
 
427 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1315  hypothetical protein  21.8 
 
 
455 aa  65.5  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.538272  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2742  hypothetical protein  25.13 
 
 
457 aa  65.5  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1424  hypothetical protein  22.49 
 
 
445 aa  65.1  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.294946  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3222  hypothetical protein  22.47 
 
 
516 aa  62.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.258134  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2985  hypothetical protein  24.08 
 
 
409 aa  61.6  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0211  hypothetical protein  24.21 
 
 
475 aa  60.8  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.359203  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2689  SH3 type 3 domain-containing protein  23.46 
 
 
676 aa  60.5  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2011  hypothetical protein  22.76 
 
 
490 aa  60.1  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4690  transcriptional regulator LysR  20.9 
 
 
527 aa  53.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.989962  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2001  hypothetical protein  25.87 
 
 
407 aa  47  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.266459  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1527  hypothetical protein  26.27 
 
 
494 aa  47  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0434  hypothetical protein  23.85 
 
 
410 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0633  hypothetical protein  31.86 
 
 
482 aa  46.2  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.616937 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0453  hypothetical protein  24.68 
 
 
410 aa  44.3  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1660  hypothetical protein  24.1 
 
 
415 aa  43.5  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>