17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2011 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2011  hypothetical protein  100 
 
 		 490 aa  1009    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1178  hypothetical protein  27.69 
 
 		 425 aa  173  5e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2226  hypothetical protein  24.45 
 
 		 602 aa  74.7  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1527  hypothetical protein  27.19 
 
 		 494 aa  71.2  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2689  SH3 type 3 domain-containing protein  23.21 
 
 		 676 aa  64.3  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0153  hypothetical protein  24.9 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2392  hypothetical protein  24.93 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.514356  normal  0.55434 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3284  hypothetical protein  22.54 
 
 		 475 aa  53.9  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08470  hypothetical protein  28.05 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2742  hypothetical protein  22.77 
 
 		 457 aa  49.7  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0960  hypothetical protein  22.03 
 
 		 483 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.364333  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1514  hypothetical protein  30.6 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0538542  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0807  hypothetical protein  20 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1660  hypothetical protein  37.66 
 
 		 415 aa  47.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1942  hypothetical protein  22.6 
 
 		 424 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351216  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1323  hypothetical protein  24.86 
 
 		 407 aa  44.3  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0434  hypothetical protein  33.78 
 
 		 410 aa  44.3  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>