30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1178 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1178  hypothetical protein  100 
 
 		 425 aa  875    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2011  hypothetical protein  27.69 
 
 		 490 aa  173  3.9999999999999995e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2392  hypothetical protein  27.36 
 
 		 453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.514356  normal  0.55434 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2226  hypothetical protein  25.37 
 
 		 602 aa  114  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0368  hypothetical protein  24.18 
 
 		 570 aa  89.4  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2985  hypothetical protein  26.57 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2689  SH3 type 3 domain-containing protein  22.75 
 
 		 676 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3284  hypothetical protein  22.71 
 
 		 475 aa  80.5  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0807  hypothetical protein  21.62 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0960  hypothetical protein  20.96 
 
 		 483 aa  70.9  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.364333  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0153  hypothetical protein  25 
 
 		 462 aa  65.5  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0211  hypothetical protein  21.93 
 
 		 475 aa  65.1  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.359203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0633  hypothetical protein  25.91 
 
 		 482 aa  62  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.616937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2785  hypothetical protein  24.49 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2970  hypothetical protein  24.49 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1527  hypothetical protein  25.54 
 
 		 494 aa  53.5  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1514  hypothetical protein  27.42 
 
 		 414 aa  53.1  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0538542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3222  hypothetical protein  22.79 
 
 		 516 aa  52.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.258134  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08470  hypothetical protein  21.88 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1424  hypothetical protein  20.28 
 
 		 445 aa  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.294946  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2001  hypothetical protein  21.16 
 
 		 407 aa  51.2  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.266459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2742  hypothetical protein  22.03 
 
 		 457 aa  50.4  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4690  transcriptional regulator LysR  22.91 
 
 		 527 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.989962  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2466  putative regulatory protein, LysR  26.13 
 
 		 512 aa  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3777  putative cox2 cytochrome oxidase subunit 2  20.93 
 
 		 657 aa  47.4  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000560662  hitchhiker  0.00392281 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1315  hypothetical protein  21.57 
 
 		 455 aa  47  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.538272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1942  hypothetical protein  21.19 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351216  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1660  hypothetical protein  30.21 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0453  hypothetical protein  28.88 
 
 		 410 aa  43.9  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0434  hypothetical protein  28.72 
 
 		 410 aa  43.5  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>