27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0807 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0807  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  898    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2392  hypothetical protein  28.9 
 
 		 453 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.514356  normal  0.55434 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0368  hypothetical protein  28.07 
 
 		 570 aa  130  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2226  hypothetical protein  25.84 
 
 		 602 aa  111  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3284  hypothetical protein  26.25 
 
 		 475 aa  106  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2785  hypothetical protein  29.29 
 
 		 427 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2970  hypothetical protein  29.29 
 
 		 427 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0960  hypothetical protein  25.06 
 
 		 483 aa  97.1  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.364333  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1178  hypothetical protein  21.62 
 
 		 425 aa  77.4  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2689  SH3 type 3 domain-containing protein  21.15 
 
 		 676 aa  71.6  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4690  transcriptional regulator LysR  22.83 
 
 		 527 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.989962  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3222  hypothetical protein  27.1 
 
 		 516 aa  70.9  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.258134  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2269  putative cox2 cytochrome oxidase subunit 2  47.06 
 
 		 677 aa  63.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2546  putative cox2 cytochrome oxidase subunit 2  47.06 
 
 		 677 aa  62.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00554628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3777  putative cox2 cytochrome oxidase subunit 2  48.33 
 
 		 657 aa  60.8  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000560662  hitchhiker  0.00392281 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0453  hypothetical protein  23.14 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0467  hypothetical protein  23.56 
 
 		 474 aa  55.1  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.874184  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2466  putative regulatory protein, LysR  24.81 
 
 		 512 aa  53.1  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0942  putative regulatory protein, LysR  25.47 
 
 		 528 aa  53.1  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0280337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1315  hypothetical protein  23.56 
 
 		 455 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.538272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0434  hypothetical protein  21.65 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1660  hypothetical protein  21.37 
 
 		 415 aa  50.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2985  hypothetical protein  23.78 
 
 		 409 aa  49.7  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1514  hypothetical protein  20.89 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0538542  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2011  hypothetical protein  20 
 
 		 490 aa  47.8  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2702  hypothetical protein  33.33 
 
 		 580 aa  44.3  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0153  hypothetical protein  20.42 
 
 		 462 aa  43.1  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>