13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2466 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2466  putative regulatory protein, LysR  100 
 
 		 512 aa  1043    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1351  transcriptional regulator LysR  42.57 
 
 		 549 aa  423  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000706303  hitchhiker  0.0000188076 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4690  transcriptional regulator LysR  48.43 
 
 		 527 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.989962  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0942  putative regulatory protein, LysR  42.19 
 
 		 528 aa  364  3e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0280337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3222  hypothetical protein  38.92 
 
 		 516 aa  334  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.258134  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0807  hypothetical protein  25.37 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2269  putative cox2 cytochrome oxidase subunit 2  22.72 
 
 		 677 aa  53.5  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2546  putative cox2 cytochrome oxidase subunit 2  22.98 
 
 		 677 aa  53.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00554628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2689  SH3 type 3 domain-containing protein  28.98 
 
 		 676 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1178  hypothetical protein  26.13 
 
 		 425 aa  48.1  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2226  hypothetical protein  34.68 
 
 		 602 aa  47.4  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3777  putative cox2 cytochrome oxidase subunit 2  22.16 
 
 		 657 aa  44.7  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000560662  hitchhiker  0.00392281 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0960  hypothetical protein  26.6 
 
 		 483 aa  43.5  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.364333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>