18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2985 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2985  hypothetical protein  100 
 
 
409 aa  837    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2226  hypothetical protein  25.22 
 
 
602 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1178  hypothetical protein  26.57 
 
 
425 aa  82  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0368  hypothetical protein  24.2 
 
 
570 aa  68.2  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2392  hypothetical protein  23.06 
 
 
453 aa  65.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.514356  normal  0.55434 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3284  hypothetical protein  24.08 
 
 
475 aa  62  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08470  hypothetical protein  25 
 
 
387 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0633  hypothetical protein  23.36 
 
 
482 aa  57  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.616937 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0153  hypothetical protein  24.06 
 
 
462 aa  53.9  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5304  hypothetical protein  22.96 
 
 
381 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374361  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0960  hypothetical protein  23.6 
 
 
483 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.364333  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1692  hypothetical protein  22.96 
 
 
381 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12804  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3222  hypothetical protein  21.43 
 
 
516 aa  50.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.258134  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1424  hypothetical protein  25.07 
 
 
445 aa  48.9  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.294946  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0807  hypothetical protein  22.03 
 
 
441 aa  49.3  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2689  SH3 type 3 domain-containing protein  21.7 
 
 
676 aa  47.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2742  hypothetical protein  23.13 
 
 
457 aa  47.4  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1315  hypothetical protein  24.16 
 
 
455 aa  44.3  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.538272  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>