11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1424 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1424  hypothetical protein  100 
 
 
445 aa  887    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.294946  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2742  hypothetical protein  67.95 
 
 
457 aa  586  1e-166  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1942  hypothetical protein  41.24 
 
 
424 aa  246  6e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351216  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0211  hypothetical protein  35.51 
 
 
475 aa  238  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.359203  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3284  hypothetical protein  22.49 
 
 
475 aa  64.7  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2392  hypothetical protein  23.92 
 
 
453 aa  60.5  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.514356  normal  0.55434 
 
 
-
 
NC_002950  PG1178  hypothetical protein  20.28 
 
 
425 aa  51.6  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2985  hypothetical protein  25.07 
 
 
409 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0368  hypothetical protein  20.99 
 
 
570 aa  48.9  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2689  SH3 type 3 domain-containing protein  22.57 
 
 
676 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0960  hypothetical protein  25.11 
 
 
483 aa  43.5  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.364333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>