16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3222 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3222  hypothetical protein  100 
 
 		 516 aa  1063    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.258134  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4690  transcriptional regulator LysR  40.62 
 
 		 527 aa  352  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.989962  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0942  putative regulatory protein, LysR  37.83 
 
 		 528 aa  350  5e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0280337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2466  putative regulatory protein, LysR  38.73 
 
 		 512 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1351  transcriptional regulator LysR  33.39 
 
 		 549 aa  283  8.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000706303  hitchhiker  0.0000188076 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0368  hypothetical protein  27.94 
 
 		 570 aa  85.9  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3777  putative cox2 cytochrome oxidase subunit 2  26.2 
 
 		 657 aa  84.7  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000560662  hitchhiker  0.00392281 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2546  putative cox2 cytochrome oxidase subunit 2  26.92 
 
 		 677 aa  81.3  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00554628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2269  putative cox2 cytochrome oxidase subunit 2  26.92 
 
 		 677 aa  80.9  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2392  hypothetical protein  26.88 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.514356  normal  0.55434 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0807  hypothetical protein  27.1 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3284  hypothetical protein  22.47 
 
 		 475 aa  62.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2226  hypothetical protein  23.22 
 
 		 602 aa  53.9  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1178  hypothetical protein  22.79 
 
 		 425 aa  52.8  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2985  hypothetical protein  21.43 
 
 		 409 aa  50.1  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2689  SH3 type 3 domain-containing protein  27.61 
 
 		 676 aa  47.4  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>