50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2226 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2226  hypothetical protein  100 
 
 		 602 aa  1232    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2392  hypothetical protein  27.68 
 
 		 453 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.514356  normal  0.55434 
 
 
-
 
NC_002950  PG1178  hypothetical protein  25.37 
 
 		 425 aa  114  4.0000000000000004e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0807  hypothetical protein  25.84 
 
 		 441 aa  110  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3284  hypothetical protein  26.76 
 
 		 475 aa  106  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0368  hypothetical protein  25.97 
 
 		 570 aa  105  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0153  hypothetical protein  24.54 
 
 		 462 aa  97.1  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1527  hypothetical protein  25.73 
 
 		 494 aa  93.6  9e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2985  hypothetical protein  25.22 
 
 		 409 aa  83.2  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0960  hypothetical protein  22.96 
 
 		 483 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.364333  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2785  hypothetical protein  26.02 
 
 		 427 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2970  hypothetical protein  26.02 
 
 		 427 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0633  hypothetical protein  24.36 
 
 		 482 aa  78.2  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.616937 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2011  hypothetical protein  24.45 
 
 		 490 aa  74.7  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08470  hypothetical protein  25.08 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2689  SH3 type 3 domain-containing protein  23.5 
 
 		 676 aa  67.8  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1660  hypothetical protein  26.42 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003707  hypothetical protein  35.04 
 
 		 391 aa  56.6  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.294697  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3222  hypothetical protein  23.22 
 
 		 516 aa  53.9  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.258134  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0453  hypothetical protein  27.32 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1514  hypothetical protein  28.04 
 
 		 414 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0538542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73040  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.35 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.487189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0434  hypothetical protein  27.07 
 
 		 410 aa  50.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1381  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.3 
 
 		 443 aa  48.9  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1942  hypothetical protein  25 
 
 		 424 aa  48.1  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351216  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6339  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.41 
 
 		 397 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3384  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.31 
 
 		 414 aa  46.6  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.25517  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2466  putative regulatory protein, LysR  34.68 
 
 		 512 aa  47  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3188  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.04 
 
 		 412 aa  47  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00703451  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2001  hypothetical protein  26.09 
 
 		 407 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.266459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0211  hypothetical protein  23.14 
 
 		 475 aa  46.2  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.359203  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0467  hypothetical protein  22.4 
 
 		 474 aa  46.2  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.874184  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4945  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  35.71 
 
 		 471 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0866  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.45 
 
 		 412 aa  45.8  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0920  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.31 
 
 		 414 aa  45.8  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65370  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.04 
 
 		 475 aa  45.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0527105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3140  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiC  32.18 
 
 		 419 aa  44.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5676  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.04 
 
 		 487 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.538418  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  33.33 
 
 		 948 aa  45.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2963  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiC  32.18 
 
 		 417 aa  44.7  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02665  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.18 
 
 		 417 aa  44.7  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0874  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.18 
 
 		 417 aa  44.7  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02626  hypothetical protein  32.18 
 
 		 417 aa  44.7  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4082  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiC  32.18 
 
 		 417 aa  44.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.354645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3045  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiC  32.18 
 
 		 417 aa  44.7  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2964  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiC  32.18 
 
 		 417 aa  44.7  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0898  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.18 
 
 		 417 aa  44.7  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3137  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiC  32.18 
 
 		 417 aa  44.7  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2742  hypothetical protein  21.64 
 
 		 457 aa  43.9  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1654  hypothetical protein  27.11 
 
 		 437 aa  43.9  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0496759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>