8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1654 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1654  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  883    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0496759  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003707  hypothetical protein  45.48 
 
 		 391 aa  335  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.294697  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0675  hypothetical protein  41.16 
 
 		 409 aa  311  1e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.652653  normal  0.969104 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0538  hypothetical protein  40.62 
 
 		 412 aa  283  4.0000000000000003e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2001  hypothetical protein  39.8 
 
 		 407 aa  283  5.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.266459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1323  hypothetical protein  38.29 
 
 		 407 aa  270  4e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2226  hypothetical protein  25.12 
 
 		 602 aa  47  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1178  hypothetical protein  21.61 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>