21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2970 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2785  hypothetical protein  99.3 
 
 		 427 aa  862    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2970  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  867    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0807  hypothetical protein  29.29 
 
 		 441 aa  99.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2689  SH3 type 3 domain-containing protein  27.15 
 
 		 676 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2226  hypothetical protein  26.02 
 
 		 602 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3284  hypothetical protein  27.03 
 
 		 475 aa  66.6  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1178  hypothetical protein  24.49 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0633  hypothetical protein  27.12 
 
 		 482 aa  54.3  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.616937 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0960  hypothetical protein  23.75 
 
 		 483 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.364333  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2392  hypothetical protein  22.04 
 
 		 453 aa  52.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.514356  normal  0.55434 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0153  hypothetical protein  25.69 
 
 		 462 aa  49.3  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1527  hypothetical protein  26.51 
 
 		 494 aa  49.7  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3777  putative cox2 cytochrome oxidase subunit 2  38.89 
 
 		 657 aa  48.9  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000560662  hitchhiker  0.00392281 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0368  hypothetical protein  22.25 
 
 		 570 aa  48.5  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2702  hypothetical protein  45.28 
 
 		 580 aa  47.8  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1323  hypothetical protein  30.09 
 
 		 407 aa  47  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2269  putative cox2 cytochrome oxidase subunit 2  55.81 
 
 		 677 aa  46.6  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2546  putative cox2 cytochrome oxidase subunit 2  55.81 
 
 		 677 aa  46.6  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00554628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0675  hypothetical protein  25.9 
 
 		 409 aa  44.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.652653  normal  0.969104 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0400  hypothetical protein  30.13 
 
 		 615 aa  43.9  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0888  hypothetical protein  27.54 
 
 		 617 aa  43.5  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00991264  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>