14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1692 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1692  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  776    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5304  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  776    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2537  hypothetical protein  31.16 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2376  hypothetical protein  27.93 
 
 		 413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199607  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05404  hypothetical protein  28.53 
 
 		 419 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001467  hypothetical protein  27.65 
 
 		 366 aa  106  8e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2508  hypothetical protein  25.88 
 
 		 448 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1432  hypothetical protein  25.21 
 
 		 425 aa  91.3  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.440324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3194  hypothetical protein  29.1 
 
 		 431 aa  90.1  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2657  hypothetical protein  27.16 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0432  hypothetical protein  26.81 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5039  hypothetical protein  23.12 
 
 		 488 aa  60.1  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2985  hypothetical protein  22.96 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0385  putative lipoprotein  35.06 
 
 		 414 aa  43.9  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>