15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4690 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4690  transcriptional regulator LysR  100 
 
 		 527 aa  1073    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.989962  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0942  putative regulatory protein, LysR  50 
 
 		 528 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0280337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2466  putative regulatory protein, LysR  48.43 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1351  transcriptional regulator LysR  41.25 
 
 		 549 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000706303  hitchhiker  0.0000188076 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3222  hypothetical protein  40.62 
 
 		 516 aa  351  1e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.258134  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2269  putative cox2 cytochrome oxidase subunit 2  23.67 
 
 		 677 aa  77.4  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2546  putative cox2 cytochrome oxidase subunit 2  23.67 
 
 		 677 aa  77  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00554628  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0807  hypothetical protein  22.83 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3777  putative cox2 cytochrome oxidase subunit 2  22.17 
 
 		 657 aa  68.6  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000560662  hitchhiker  0.00392281 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2392  hypothetical protein  25.32 
 
 		 453 aa  67.8  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.514356  normal  0.55434 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0368  hypothetical protein  23.54 
 
 		 570 aa  58.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2689  SH3 type 3 domain-containing protein  29.27 
 
 		 676 aa  57.4  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3284  hypothetical protein  20.9 
 
 		 475 aa  53.5  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1178  hypothetical protein  22.91 
 
 		 425 aa  48.9  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0467  hypothetical protein  23.1 
 
 		 474 aa  43.9  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.874184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>