More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0734 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 208 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  61.29 
 
 		 151 aa  172  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  55.29 
 
 		 175 aa  171  9e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  54.97 
 
 		 178 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  66.38 
 
 		 168 aa  159  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  65.52 
 
 		 124 aa  156  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  62.07 
 
 		 184 aa  155  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  64.66 
 
 		 127 aa  155  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  62.93 
 
 		 155 aa  153  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  58.97 
 
 		 126 aa  138  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  67.01 
 
 		 144 aa  136  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  57.27 
 
 		 229 aa  134  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  59.48 
 
 		 146 aa  134  9e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  48.26 
 
 		 172 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  57.76 
 
 		 141 aa  133  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  52.27 
 
 		 137 aa  132  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 		 141 aa  132  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  59.48 
 
 		 140 aa  132  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0451  50S ribosomal protein L17  58.62 
 
 		 119 aa  132  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.701542  normal  0.045023 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  57.41 
 
 		 112 aa  132  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  56 
 
 		 128 aa  131  6e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1961  50S ribosomal protein L17  58.62 
 
 		 158 aa  131  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  56.1 
 
 		 127 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2046  50S ribosomal protein L17  57.76 
 
 		 164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0786511  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  56.1 
 
 		 127 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  56.1 
 
 		 127 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  56.1 
 
 		 127 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  56.1 
 
 		 127 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  55.2 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  59.26 
 
 		 112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1918  50S ribosomal protein L17  57.76 
 
 		 162 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  55.2 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  42.94 
 
 		 179 aa  129  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  49.62 
 
 		 190 aa  129  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 176 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  55.28 
 
 		 127 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  55.28 
 
 		 127 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  55.28 
 
 		 127 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  56.03 
 
 		 141 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  55.28 
 
 		 127 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  55.28 
 
 		 127 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 		 141 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  55.28 
 
 		 127 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  55.28 
 
 		 127 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  55.28 
 
 		 127 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  56.03 
 
 		 143 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  55.28 
 
 		 127 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6582  ribosomal protein L17  46.63 
 
 		 196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1939  50S ribosomal protein L17  56.9 
 
 		 168 aa  128  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  55.37 
 
 		 128 aa  128  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  55.17 
 
 		 137 aa  128  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  55.28 
 
 		 132 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  55.28 
 
 		 130 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  56.9 
 
 		 130 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  56.9 
 
 		 131 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2230  50S ribosomal protein L17  55.37 
 
 		 162 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025919  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  55.28 
 
 		 132 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  56.9 
 
 		 129 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  56.9 
 
 		 129 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  55.37 
 
 		 129 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  56.9 
 
 		 129 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  58.33 
 
 		 113 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  58.33 
 
 		 113 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  56.9 
 
 		 131 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  56.9 
 
 		 130 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0515  50S ribosomal protein L17  56.03 
 
 		 119 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336065 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  56.48 
 
 		 112 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  54.05 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0510  50S ribosomal protein L17  56.03 
 
 		 119 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.698201  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  52.03 
 
 		 134 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  50.77 
 
 		 139 aa  126  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 		 140 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 113 aa  126  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 		 140 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4030  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 131 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544073  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 131 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  53.57 
 
 		 268 aa  125  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 131 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 131 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 120 aa  125  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 120 aa  125  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 120 aa  125  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 120 aa  125  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 120 aa  125  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 120 aa  125  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 120 aa  125  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 120 aa  125  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 120 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  54.63 
 
 		 112 aa  125  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0225  50S ribosomal protein L17  56.9 
 
 		 131 aa  125  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000697417  unclonable  0.0000000000243576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0220  50S ribosomal protein L17  56.9 
 
 		 131 aa  125  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 120 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  56.9 
 
 		 131 aa  125  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  56.03 
 
 		 126 aa  125  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 120 aa  125  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  56.9 
 
 		 130 aa  125  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0196  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 131 aa  125  7e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00364658  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0174  50S ribosomal protein L17  56.9 
 
 		 131 aa  124  7e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000106796  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0239  50S ribosomal protein L17  56.03 
 
 		 131 aa  124  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00616795  unclonable  0.00000909756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>