More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4348 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4348  penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 697 aa  1429    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1638  peptidoglycan glycosyltransferase  37.64 
 
 		 703 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0646938  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0540  peptidoglycan glycosyltransferase  39.77 
 
 		 689 aa  405  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.725377 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  36.27 
 
 		 661 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  37.98 
 
 		 646 aa  379  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  34.29 
 
 		 655 aa  357  2.9999999999999997e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  36.09 
 
 		 658 aa  353  7e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2131  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.91 
 
 		 761 aa  292  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0043802  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  30.19 
 
 		 639 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  30.07 
 
 		 645 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  30.23 
 
 		 643 aa  279  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  30.09 
 
 		 645 aa  275  3e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  30.92 
 
 		 703 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  30.32 
 
 		 679 aa  269  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2465  penicillin-binding protein 2  30.59 
 
 		 686 aa  265  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1685  penicillin-binding protein 2  29.92 
 
 		 670 aa  263  6e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361275  normal  0.0578136 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  28.82 
 
 		 636 aa  262  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  30.88 
 
 		 636 aa  260  7e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3385  penicillin-binding protein 2  30.88 
 
 		 716 aa  258  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.157729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  29.38 
 
 		 767 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  29.38 
 
 		 771 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.27 
 
 		 671 aa  252  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  29.02 
 
 		 802 aa  251  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  29.02 
 
 		 803 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  29.02 
 
 		 809 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  30.53 
 
 		 681 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  29.8 
 
 		 633 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  29.96 
 
 		 609 aa  245  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  28.88 
 
 		 803 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  29.02 
 
 		 802 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  29.02 
 
 		 802 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  30.53 
 
 		 619 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.29 
 
 		 618 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  29.02 
 
 		 802 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  29.02 
 
 		 802 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0286  penicillin-binding protein 2  28.49 
 
 		 655 aa  244  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0176  peptidoglycan glycosyltransferase  29.9 
 
 		 683 aa  244  5e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  28.49 
 
 		 646 aa  242  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  28.71 
 
 		 800 aa  242  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  29.68 
 
 		 635 aa  240  5e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0518  penicillin-binding protein 2  30.75 
 
 		 625 aa  240  5.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002903 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  29.12 
 
 		 618 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  29.12 
 
 		 618 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  28.88 
 
 		 673 aa  239  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  29.12 
 
 		 618 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  29.12 
 
 		 618 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  29.04 
 
 		 618 aa  238  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  27.95 
 
 		 615 aa  238  4e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  29.01 
 
 		 801 aa  237  5.0000000000000005e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  29.21 
 
 		 611 aa  237  6e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  27.95 
 
 		 612 aa  236  7e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  28.72 
 
 		 627 aa  236  7e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0297  peptidoglycan glycosyltransferase  28.7 
 
 		 648 aa  236  9e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  28.65 
 
 		 610 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  28.63 
 
 		 637 aa  234  4.0000000000000004e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  28.92 
 
 		 766 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  30.07 
 
 		 709 aa  233  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1741  penicillin-binding protein 2  28.61 
 
 		 635 aa  233  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  30.47 
 
 		 691 aa  232  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  28.53 
 
 		 618 aa  232  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2661  penicillin-binding protein 2  29.1 
 
 		 667 aa  232  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0225  peptidoglycan glycosyltransferase  28.55 
 
 		 691 aa  230  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.466269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  27.69 
 
 		 643 aa  229  9e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0236  penicillin-binding protein 2  29.58 
 
 		 646 aa  228  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0864486  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  28.32 
 
 		 618 aa  228  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  28.32 
 
 		 618 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  28.32 
 
 		 618 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0242  peptidoglycan glycosyltransferase  29.58 
 
 		 646 aa  229  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  27.95 
 
 		 650 aa  228  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  28.74 
 
 		 664 aa  228  3e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  27.95 
 
 		 626 aa  228  4e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  28.36 
 
 		 640 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  28.02 
 
 		 793 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  28.18 
 
 		 618 aa  227  6e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  27.19 
 
 		 597 aa  227  7e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1715  penicillin-binding protein  28.06 
 
 		 652 aa  226  9e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  28.39 
 
 		 801 aa  226  9e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  28.39 
 
 		 801 aa  225  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1542  penicillin-binding protein 2  27.42 
 
 		 697 aa  226  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316426  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  29.53 
 
 		 634 aa  224  4.9999999999999996e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  27.22 
 
 		 637 aa  222  1.9999999999999999e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3462  peptidoglycan glycosyltransferase  28.96 
 
 		 708 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.031761  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  28.88 
 
 		 619 aa  221  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  26.95 
 
 		 646 aa  221  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  27.82 
 
 		 618 aa  220  7e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  27.98 
 
 		 627 aa  220  7e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0769  penicillin-binding protein 2  27.69 
 
 		 644 aa  218  4e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.116672  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0357  penicillin-binding protein 2  27.95 
 
 		 681 aa  217  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4035  peptidoglycan glycosyltransferase  28.33 
 
 		 647 aa  216  8e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3149  peptidoglycan glycosyltransferase  27.66 
 
 		 618 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000790878  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1336  penicillin-binding protein 2  27.03 
 
 		 623 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.692108  hitchhiker  0.0000020031 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2070  penicillin-binding protein 2  27.03 
 
 		 623 aa  214  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000525085 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2065  penicillin-binding protein 2  27.03 
 
 		 623 aa  214  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180725  normal  0.157728 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1212  penicillin-binding protein 2  27.03 
 
 		 623 aa  214  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  30.95 
 
 		 647 aa  213  7e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7282  penicillin-binding protein 2  29.13 
 
 		 724 aa  213  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2125  penicillin-binding protein 2  27.03 
 
 		 623 aa  213  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000381771 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0671  peptidoglycan glycosyltransferase  29.05 
 
 		 687 aa  213  1e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.195303  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  27.73 
 
 		 617 aa  213  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0590  penicillin-binding protein 2  29.05 
 
 		 687 aa  213  1e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>