206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4269 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4269  formate dehydrogenase, gamma subunit  100 
 
 
227 aa  462  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.308563  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1823  formate dehydrogenase gamma subunit  49.08 
 
 
219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0797  formate dehydrogenase gamma subunit  39.83 
 
 
229 aa  155  6e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.205396  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0452  formate dehydrogenase gamma subunit  38.18 
 
 
226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3488  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.02 
 
 
208 aa  94.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136501  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1927  formate dehydrogenase, putative  27.68 
 
 
220 aa  89.4  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.58806  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0870  formate dehydrogenase gamma subunit  27.15 
 
 
222 aa  87  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0086  formate dehydrogenase-O subunit gamma  29.28 
 
 
211 aa  86.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2640  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.96 
 
 
204 aa  85.1  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.174669 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1573  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.96 
 
 
204 aa  85.1  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1816  formate dehydrogenase gamma subunit  30.1 
 
 
206 aa  84.7  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.621402  normal  0.0631982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7398  formate dehydrogenase gamma subunit  26.27 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.757877  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1208  formate dehydrogenase, gamma subunit, putative  27.39 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2551  formate dehydrogenase gamma subunit  28.97 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233004  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4087  formate dehydrogenase-O subunit gamma  29.02 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03777  formate dehydrogenase-O, cytochrome b556 subunit  28.18 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4092  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.18 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4371  formate dehydrogenase-O subunit gamma  28.18 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4126  formate dehydrogenase-O subunit gamma  28.18 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5342  formate dehydrogenase-O subunit gamma  28.18 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.412643 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03726  hypothetical protein  28.18 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4120  formate dehydrogenase-O subunit gamma  28.18 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4278  formate dehydrogenase-O subunit gamma  28.18 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4421  formate dehydrogenase-O subunit gamma  28.18 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4361  formate dehydrogenase-O subunit gamma  28.18 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03830  formate dehydrogenase, gamma subunit  30.23 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.129559  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1684  formate dehydrogenase-N subunit gamma  27.65 
 
 
218 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1775  formate dehydrogenase-N subunit gamma  27.65 
 
 
218 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4248  formate dehydrogenase-O subunit gamma  28.18 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.661793  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1682  formate dehydrogenase-N subunit gamma  27.65 
 
 
218 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798131  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1597  formate dehydrogenase-N subunit gamma  27.65 
 
 
218 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4315  formate dehydrogenase-O subunit gamma  28.18 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4270  formate dehydrogenase-O subunit gamma  28.18 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1745  formate dehydrogenase-N subunit gamma  27.65 
 
 
218 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.504585  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4426  formate dehydrogenase-O subunit gamma  28.18 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1427  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.69 
 
 
696 aa  79.3  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000366898  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0440  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.68 
 
 
214 aa  79  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6558  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.04 
 
 
218 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892588  hitchhiker  0.000719745 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4520  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.99 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4595  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.84 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.473714  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2336  formate dehydrogenase gamma subunit  26.16 
 
 
240 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.723504  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1681  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.88 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0728  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.88 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2700  formate dehydrogenase gamma subunit  25.68 
 
 
217 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.604172  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3542  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.31 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0474806  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2394  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.88 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0099056  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2257  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.88 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3379  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.79 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.765789  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1694  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.88 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3881  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.79 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.208966  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2098  formate dehydrogenase gamma subunit  26.85 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.976655  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1901  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.43 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335747  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0573  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.43 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15666  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2087  hypothetical protein  25.79 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000659531  hitchhiker  0.0000000000148039 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0546  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.15 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2451  formate dehydrogenase gamma subunit  30.09 
 
 
339 aa  75.5  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0779662  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3706  formate dehydrogenase, gamma subunit  30.36 
 
 
340 aa  74.7  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2583  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.39 
 
 
387 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.959541  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4380  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.85 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.212016  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3986  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.85 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1395  formate dehydrogenase, gamma subunit  31.08 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.798928  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5489  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.17 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4117  formate dehydrogenase-O subunit gamma  28.77 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2179  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.39 
 
 
387 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364942  normal  0.0604921 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0040  formate dehydrogenase-O subunit gamma  28.77 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3768  formate dehydrogenase-O subunit gamma  28.77 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0635  formate dehydrogenase gamma subunit  25.74 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.11337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2091  formate dehydrogenase gamma subunit  27.57 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354882 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3372  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.27 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2517  formate dehydrogenase-O subunit gamma  29.6 
 
 
211 aa  72  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0709  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.39 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1429  formate dehydrogenase-O subunit gamma  26.24 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2052  formate dehydrogenase-N subunit gamma  26.85 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.691652  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2865  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.15 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.019159  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3263  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.87 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.688526  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3797  formate dehydrogenase gamma subunit  30.3 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2425  formate dehydrogenase gamma subunit  30.45 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.157549 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0506  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.39 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.579311 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3327  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.01 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.582941 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1333  formate dehydrogenase-N subunit gamma  25.47 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3726  formate dehydrogenase gamma subunit  29.79 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.497698 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3922  formate dehydrogenase gamma subunit  29.79 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1752  formate dehydrogenase-N subunit gamma  26.61 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.125669  hitchhiker  0.000744815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0525  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.15 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.903346 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1118  formate dehydrogenase, cytochrome B556 subunit  31.42 
 
 
357 aa  68.9  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01434  formate dehydrogenase-N, cytochrome B556 (gamma) subunit, nitrate-inducible  27.65 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2171  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.65 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2181  formate dehydrogenase-N subunit gamma  27.65 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01446  hypothetical protein  27.65 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1698  formate dehydrogenase-N subunit gamma  27.65 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2088  formate dehydrogenase-N subunit gamma  27.65 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2370  hypothetical protein  27.63 
 
 
384 aa  68.6  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536493 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1658  formate dehydrogenase-N subunit gamma  27.19 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1739  formate dehydrogenase-N subunit gamma  27.19 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.351233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1559  formate dehydrogenase-N subunit gamma  27.19 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0491  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.69 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0103  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, cytochrome b556 subunit  27.56 
 
 
213 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2660  formate dehydrogenase-N subunit gamma  24.89 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.485157  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3756  formate dehydrogenase gamma subunit  26.29 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0534  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.13 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.793467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>