57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5596 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 531 aa  1075    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  46.97 
 
 		 462 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  37.74 
 
 		 504 aa  325  1e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 		 445 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2443  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 		 457 aa  137  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000052902  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2087  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 446 aa  134  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000442741  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  22.73 
 
 		 453 aa  130  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 446 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3236  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 		 513 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.113654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2800  hypothetical protein  25.97 
 
 		 397 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  24.08 
 
 		 474 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  26.49 
 
 		 476 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3428  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 482 aa  114  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 445 aa  115  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 444 aa  114  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  25.26 
 
 		 474 aa  114  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  25.26 
 
 		 474 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0357  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 472 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 495 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0367  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 472 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0364  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 472 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  24.87 
 
 		 491 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0359  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 480 aa  104  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2212  hypothetical protein  28.54 
 
 		 490 aa  100  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.814869  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  22.63 
 
 		 471 aa  97.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 450 aa  94.7  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0373  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 459 aa  92  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.259758  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  26.65 
 
 		 461 aa  91.7  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0968  major facilitator superfamily protein  21.67 
 
 		 468 aa  90.9  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.623645  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0184  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 470 aa  90.5  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012641 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0355  major facilitator transporter  22.85 
 
 		 459 aa  89.4  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720237  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 461 aa  87.4  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  23.12 
 
 		 454 aa  86.7  9e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  26.15 
 
 		 440 aa  79.7  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1907  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 469 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000193036  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0233  major facilitator superfamily MFS_1  21.34 
 
 		 457 aa  75.9  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  23.8 
 
 		 440 aa  68.2  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0029  major facilitator superfamily MFS_1  23.55 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 413 aa  67  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5604  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 		 457 aa  63.9  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.638903  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0793  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 482 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320766 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0201  major facilitator superfamily MFS_1  21.78 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 440 aa  54.7  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 419 aa  54.3  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0397  hypothetical protein  20.79 
 
 		 422 aa  53.9  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0195929  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3317  major facilitator transporter  21.77 
 
 		 427 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 		 405 aa  50.1  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3888  major facilitator transporter  22.33 
 
 		 427 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  22.65 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0421  major facilitator superfamily MFS_1  21 
 
 		 433 aa  47.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0364  major facilitator transporter  23.83 
 
 		 450 aa  45.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.877458  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2623  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 438 aa  45.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0165  major facilitator transporter  21.45 
 
 		 415 aa  44.7  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000668995  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  22.32 
 
 		 438 aa  43.5  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5055  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.84 
 
 		 522 aa  43.5  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.663135  normal  0.937687 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>