More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4459 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4459  malate dehydrogenase, NAD-dependent  100 
 
 		 309 aa  624  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.688925 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4496  malate dehydrogenase, NAD-dependent  76.55 
 
 		 313 aa  485  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.794515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2255  malate dehydrogenase  71.24 
 
 		 311 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0864  malate dehydrogenase, NAD-dependent  69.93 
 
 		 312 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343298 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1689  Lactate/malate dehydrogenase  65.03 
 
 		 310 aa  414  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.444612  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08746  malate dehydrogenase  62.66 
 
 		 308 aa  392  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3020  malate dehydrogenase (NAD)  56.03 
 
 		 312 aa  328  5.0000000000000004e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0912  malate dehydrogenase, NAD-dependent  53.33 
 
 		 312 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0881394  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1656  malate dehydrogenase, NAD-dependent  54.4 
 
 		 312 aa  318  7.999999999999999e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4206  malate dehydrogenase  53.16 
 
 		 314 aa  311  6.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0253  malate dehydrogenase  51.47 
 
 		 309 aa  307  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.041825  normal  0.0135962 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1121  malate dehydrogenase  47.4 
 
 		 309 aa  300  2e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0283  malate dehydrogenase  49.51 
 
 		 309 aa  299  4e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1029  malate dehydrogenase  48.5 
 
 		 310 aa  296  3e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758057  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0862  malate dehydrogenase  46.84 
 
 		 310 aa  293  2e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0390301  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1273  malate dehydrogenase  48.67 
 
 		 324 aa  292  5e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.570878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2677  malate dehydrogenase  47.37 
 
 		 312 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2374  malate dehydrogenase, NAD-dependent  47.02 
 
 		 311 aa  286  4e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3276  malate dehydrogenase  45.95 
 
 		 312 aa  285  8e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0783  malate dehydrogenase  47.37 
 
 		 312 aa  285  8e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1510  malate dehydrogenase  45.34 
 
 		 310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0354026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1867  malate dehydrogenase  47.51 
 
 		 308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00765461  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4707  malate dehydrogenase  46.43 
 
 		 312 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597561 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4723  malate dehydrogenase  46.43 
 
 		 312 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4486  malate dehydrogenase  46.43 
 
 		 312 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4321  malate dehydrogenase  46.43 
 
 		 312 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4837  malate dehydrogenase  46.43 
 
 		 312 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4702  malate dehydrogenase  46.43 
 
 		 312 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0536  malate dehydrogenase  46.43 
 
 		 312 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00988703 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4718  malate dehydrogenase  46.43 
 
 		 312 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4333  malate dehydrogenase  46.43 
 
 		 312 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4422  malate dehydrogenase  46.1 
 
 		 312 aa  280  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1900  malate dehydrogenase  45.51 
 
 		 310 aa  279  5e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2178  malate dehydrogenase, NAD-dependent  45.93 
 
 		 326 aa  278  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00838959 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1951  malate dehydrogenase (NAD)  47.35 
 
 		 308 aa  278  7e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.800681 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1748  malate dehydrogenase  44.81 
 
 		 307 aa  278  8e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.747056 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2290  malate dehydrogenase  48.84 
 
 		 309 aa  276  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.974079 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0832  malate dehydrogenase  44.85 
 
 		 310 aa  275  8e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_393  malate dehydrogenase, NAD-dependent  46.75 
 
 		 308 aa  273  3e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.871516  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2347  malate dehydrogenase, NAD-dependent  47.25 
 
 		 311 aa  273  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1121  malate dehydrogenase  42.12 
 
 		 316 aa  271  8.000000000000001e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1713  malate dehydrogenase  45.19 
 
 		 310 aa  271  8.000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.905202  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1603  malate dehydrogenase  45.36 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0428  malate dehydrogenase  45.78 
 
 		 307 aa  270  2e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1088  malate dehydrogenase, NAD-dependent  42.86 
 
 		 316 aa  269  4e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00100592  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0451  malate dehydrogenase  46.1 
 
 		 307 aa  268  7e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2185  malate dehydrogenase  44.01 
 
 		 312 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0347  malate dehydrogenase  42.58 
 
 		 313 aa  264  1e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536254  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4129  malate dehydrogenase  42.54 
 
 		 320 aa  265  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1450  malate dehydrogenase, NAD-dependent  42.67 
 
 		 333 aa  263  4e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2802  malate dehydrogenase, NAD-dependent  44.01 
 
 		 311 aa  262  6e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2230  malate dehydrogenase  42.35 
 
 		 320 aa  261  1e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0522  malate dehydrogenase, NAD-dependent  42.19 
 
 		 320 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0539  malate dehydrogenase, NAD-dependent  42.19 
 
 		 320 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0187  malate dehydrogenase  42.67 
 
 		 322 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433088  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1325  malate dehydrogenase  44.37 
 
 		 317 aa  258  7e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000410815 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1675  malate dehydrogenase  43.62 
 
 		 309 aa  258  7e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0291374  normal  0.817536 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0624  malate dehydrogenase  42.27 
 
 		 332 aa  258  8e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000517637  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1856  malate dehydrogenase  42.58 
 
 		 320 aa  256  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1587  malate dehydrogenase, NAD-dependent  41.99 
 
 		 320 aa  257  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0930  malate dehydrogenase  42.58 
 
 		 320 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1300  malate dehydrogenase  41.69 
 
 		 320 aa  256  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1182  malate dehydrogenase  41.69 
 
 		 320 aa  256  3e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333007  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3395  malate dehydrogenase  40.65 
 
 		 321 aa  256  3e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1048  malate dehydrogenase  43.97 
 
 		 319 aa  256  4e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.466907  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1927  malate dehydrogenase  42.58 
 
 		 320 aa  256  5e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1140  malate dehydrogenase, NAD-dependent  43.52 
 
 		 307 aa  255  5e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.208998  normal  0.907929 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2829  malate dehydrogenase (NAD)  41.29 
 
 		 320 aa  255  6e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2193  malate dehydrogenase  43.59 
 
 		 318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000748395  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0968  malate dehydrogenase  40.72 
 
 		 338 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2628  malate dehydrogenase  40.72 
 
 		 320 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2876  malate dehydrogenase  40.65 
 
 		 320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0022  malate dehydrogenase  40.07 
 
 		 321 aa  252  5.000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2900  malate dehydrogenase  42.77 
 
 		 317 aa  252  7e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000048511  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1626  malate dehydrogenase  41.75 
 
 		 312 aa  251  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0561  malate dehydrogenase  40.38 
 
 		 320 aa  251  9.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394685  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5004  malate dehydrogenase  40.71 
 
 		 320 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0080  malate dehydrogenase  40.06 
 
 		 320 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0194  malate dehydrogenase  42.67 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0545  malate dehydrogenase  42.35 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.557349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1799  malate dehydrogenase, NAD-dependent  43.05 
 
 		 320 aa  250  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0535  malate dehydrogenase  43.32 
 
 		 322 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0605  malate dehydrogenase  41.4 
 
 		 332 aa  248  7e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1643  malate dehydrogenase, NAD-dependent  42.02 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160131  normal  0.329919 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0419  malate dehydrogenase  41.37 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1925  malate dehydrogenase, NAD-dependent  42.02 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.451174 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0281  malate dehydrogenase  42.67 
 
 		 322 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1466  malate dehydrogenase  42.41 
 
 		 317 aa  246  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0862702  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0919  malate dehydrogenase, NAD-dependent  41.69 
 
 		 320 aa  246  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0398  malate dehydrogenase  39.09 
 
 		 313 aa  246  3e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0612  malate dehydrogenase  39.47 
 
 		 309 aa  245  6.999999999999999e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000000109591 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2971  malate dehydrogenase, NAD-dependent  41 
 
 		 307 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.184219  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1625  malate dehydrogenase  40.63 
 
 		 321 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000635356  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0956  malate dehydrogenase, NAD-dependent  41.1 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1699  malate dehydrogenase  40 
 
 		 309 aa  243  3e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000446484 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1589  malate dehydrogenase  41.61 
 
 		 316 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0268739 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0338  malate dehydrogenase  40.94 
 
 		 304 aa  242  6e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1123  malate dehydrogenase, NAD-dependent  41.51 
 
 		 320 aa  241  9e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117995  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0697  malate dehydrogenase  42.14 
 
 		 309 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5970  malate dehydrogenase, NAD-dependent  42.11 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284223  normal  0.475687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>