More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3467 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3467  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 		 195 aa  394  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5674  cytochrome c oxidase subunit III  65.98 
 
 		 196 aa  284  5e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.842654 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2203  cytochrome c oxidase, subunit III  53.98 
 
 		 180 aa  200  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000157592  normal  0.966564 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0520  cytochrome c oxidase subunit III  36.42 
 
 		 187 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0779441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2266  cytochrome c oxidase subunit III  37.28 
 
 		 237 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4943  cytochrome c oxidase, subunit III  34.59 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0298  cytochrome c oxidase, subunit III  36.32 
 
 		 196 aa  117  9e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000397561 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01170  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  115  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2427  cytochrome c oxidase subunit III  31.91 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2476  cytochrome c oxidase, subunit III  34.25 
 
 		 235 aa  111  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314801  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2592  cytochrome c oxidase subunit III  39.01 
 
 		 237 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2343  cytochrome c oxidase subunit III  33.14 
 
 		 202 aa  108  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4112  cytochrome c oxidase, subunit III  30.46 
 
 		 203 aa  99.8  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.771178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3957  cytochrome c oxidase subunit III  30.95 
 
 		 222 aa  98.6  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.179765 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  31.91 
 
 		 208 aa  98.6  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0252  cytochrome c oxidase subunit III  32.39 
 
 		 222 aa  97.4  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00632373 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0439  cytochrome c oxidase subunit III  33.51 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0988011 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5128  cytochrome oxidase subunit III oxidase polypeptide I  29.12 
 
 		 209 aa  94  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3634  cytochrome c oxidase subunit III  32.16 
 
 		 215 aa  93.2  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3896  cytochrome c oxidase  29.48 
 
 		 267 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0728  cytochrome c oxidase subunit III  31.33 
 
 		 202 aa  88.6  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1566  cytochrome-C oxidase oxidoreductase protein  37.41 
 
 		 202 aa  88.2  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4874  cytochrome c oxidase subunit III  33.74 
 
 		 202 aa  85.5  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.108668 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3797  cytochrome c oxidase subunit III  33.74 
 
 		 202 aa  85.5  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  35.94 
 
 		 288 aa  85.5  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  29.47 
 
 		 832 aa  82.4  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  31.95 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  32.54 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  37.5 
 
 		 291 aa  81.3  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  30.81 
 
 		 199 aa  81.3  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0009  cytochrome c oxidase, subunit III  32.45 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2332  cytochrome c oxidase, subunit III  34.81 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.938653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  29.41 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  28.76 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1857  Cytochrome-c oxidase  28.35 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2808  cytochrome c oxidase, subunit III  32.81 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0187  cytochrome c oxidase, subunit III  32.37 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6211  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like protein  32.24 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0523  cytochrome c oxidase subunit III  32.8 
 
 		 292 aa  78.2  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  30.41 
 
 		 208 aa  77.8  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5938  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like protein  32.24 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2959  cytochrome c oxidase, subunit III  32.03 
 
 		 289 aa  77.8  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1045  cytochrome c oxidase subunit III  32.8 
 
 		 292 aa  77.8  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  27.87 
 
 		 819 aa  77.8  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0676  cytochrome c oxidase, subunit III  34.53 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  29.74 
 
 		 827 aa  77.4  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0746  cytochrome c oxidase, subunit III  30.57 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0126142  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2229  cytochrome c oxidase, subunit III  33.59 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.0161512 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  27.36 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  33.87 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0985  cytochrome c oxidase subunit III  28.35 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  27.78 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  30.69 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3647  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.34 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.435887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1211  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.71 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  31.21 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  33.33 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0918  cytochrome c oxidase, subunit III  36.13 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.163295  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  29.69 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  29.59 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2105  cytochrome c oxidase, subunit III  29.71 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  31.79 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  31.79 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  31.79 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0586  cytochrome c oxidase subunit III  32 
 
 		 292 aa  74.7  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141909  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  31.52 
 
 		 294 aa  74.7  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  31.02 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  32.35 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  30.16 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  34.92 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7360  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  30.72 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5374  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  30.29 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.529066 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0039  cytochrome c oxidase, subunit III  31.78 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4071  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.27 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.953748  n/a   
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  30.99 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4643  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162674  normal  0.0685685 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47180  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.27 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.121208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2069  cytochrome c oxidase, subunit III  29.14 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  33.59 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2088  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.14 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1775  cytochrome c oxidase, subunit III  33.06 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.474644  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  31.61 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  31.61 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  34.15 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  31.01 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04010  Cytochrome c oxidase subunit III  31.3 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6008  cytochrome c oxidase, subunit III  29.14 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0674382  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  31.61 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  28.93 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1975  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.14 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  31.2 
 
 		 439 aa  72.8  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  30.39 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2360  cytochrome c oxidase subunit III  29.14 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  32 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  30.39 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0472  cytochrome c oxidase, subunit III  31.2 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  30.64 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  34.75 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  34.35 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  29.69 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>