128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2788 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2788  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 257 aa  537  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0722811 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1281  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.94 
 
 		 265 aa  232  5e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3797  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.83 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117208 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0980  hypothetical protein  30.6 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0812833  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1182  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.18 
 
 		 374 aa  58.9  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3069  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.41 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6016  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.69 
 
 		 343 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4648  hypothetical protein  28.64 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00489554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.1 
 
 		 367 aa  55.8  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42040  hypothetical protein  31.14 
 
 		 386 aa  55.5  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3922  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.83 
 
 		 379 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.393872  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0591  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.72 
 
 		 373 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2127  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.9 
 
 		 367 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3067  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.65 
 
 		 374 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3490  Fic family protein  28.9 
 
 		 376 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0823  Fic family protein  28.9 
 
 		 389 aa  53.5  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4776  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.88 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199218  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3619  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.9 
 
 		 376 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0227  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.82 
 
 		 376 aa  53.1  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424748  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2616  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.37 
 
 		 368 aa  53.1  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3413  hypothetical protein  27.84 
 
 		 371 aa  53.1  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0182  Fic family protein  28.65 
 
 		 352 aa  52.8  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1770  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.75 
 
 		 370 aa  52.8  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.385293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5385  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.57 
 
 		 370 aa  52.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4935  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.64 
 
 		 373 aa  52.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684685  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3441  hypothetical protein  33.11 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4586  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.9 
 
 		 372 aa  51.6  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1262  hypothetical protein  27.17 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.254788  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4506  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.72 
 
 		 365 aa  50.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0416  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.94 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1095  filamentation induced by cAMP protein (Fic) family protein  26.37 
 
 		 374 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.298399  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2915  hypothetical protein  33.04 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00165114  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1403  MloA  24.82 
 
 		 359 aa  50.1  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.10524  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1551  hypothetical protein  31.06 
 
 		 314 aa  50.1  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4231  hypothetical protein  26.84 
 
 		 364 aa  49.3  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.758484 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5763  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.44 
 
 		 374 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6128  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.44 
 
 		 374 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6610  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.44 
 
 		 374 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.578306 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2002  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.94 
 
 		 375 aa  48.9  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0460  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.52 
 
 		 388 aa  48.9  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3792  hypothetical protein  26.11 
 
 		 365 aa  48.9  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  27.22 
 
 		 328 aa  48.5  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7631  filamentation induced by cAMP protein, Fic  26.51 
 
 		 386 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.223579 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0937  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.47 
 
 		 368 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2669  Fic family protein  31.11 
 
 		 330 aa  48.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1441  hypothetical protein  34.94 
 
 		 367 aa  47.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0823  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.71 
 
 		 374 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0723  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.29 
 
 		 373 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.43274  hitchhiker  0.00000454462 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1366  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.49 
 
 		 371 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2357  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.96 
 
 		 371 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0092  fic family protein  26.09 
 
 		 358 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3993  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.88 
 
 		 353 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.284344 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28800  hypothetical protein  32.5 
 
 		 331 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287413  decreased coverage  0.000000000406133 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0677  hypothetical protein  28.92 
 
 		 373 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00227082  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0094  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.09 
 
 		 387 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0887  Fic family protein  26.29 
 
 		 378 aa  46.6  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1129  Fic family protein  26.29 
 
 		 378 aa  46.6  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0523  Fic family protein  26.95 
 
 		 376 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3312  hypothetical protein  29.41 
 
 		 376 aa  46.2  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00970462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2299  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.34 
 
 		 361 aa  46.2  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0673  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.46 
 
 		 398 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.974543  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4758  filamentation induced by cAMP protein Fic  25 
 
 		 373 aa  46.2  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7373  hypothetical protein  31.78 
 
 		 368 aa  46.2  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.269183  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0095  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.81 
 
 		 429 aa  45.8  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2545  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.97 
 
 		 247 aa  45.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.992105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5004  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.07 
 
 		 381 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1455  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.43 
 
 		 429 aa  45.8  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184885  normal  0.0996953 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.56 
 
 		 358 aa  45.4  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0037  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.42 
 
 		 392 aa  45.8  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2315  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.45 
 
 		 376 aa  45.4  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.655269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3305  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.57 
 
 		 393 aa  45.4  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.735842 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0369  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.65 
 
 		 371 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1091  hypothetical protein  30 
 
 		 369 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4664  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.27 
 
 		 376 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.433809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2285  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.63 
 
 		 250 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0777  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.32 
 
 		 356 aa  44.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4104  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0010  hypothetical protein  23.71 
 
 		 383 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.96 
 
 		 384 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2737  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.41 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0264056  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4148  filamentation induced by cAMP protein Fic  40 
 
 		 359 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0617  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.27 
 
 		 393 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1350  filamentation induced by cAMP protein Fic  51.06 
 
 		 443 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2528  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.07 
 
 		 357 aa  43.9  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0361  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.65 
 
 		 371 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0366  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.65 
 
 		 375 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4817  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.31 
 
 		 379 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4924  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.12 
 
 		 369 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928256 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1723  MloA protein, putative  29.77 
 
 		 356 aa  43.5  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.325605  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0471  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.85 
 
 		 393 aa  43.9  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.586751  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05510  hypothetical protein  48 
 
 		 394 aa  43.5  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1532  filamentation induced by cAMP protein Fic  58.06 
 
 		 438 aa  43.5  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1773  filamentation induced by cAMP protein Fic  25 
 
 		 318 aa  43.5  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0104845 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1955  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.41 
 
 		 333 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07450  hypothetical protein  26.51 
 
 		 373 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000039973  normal  0.18978 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0625  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.68 
 
 		 392 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.849792  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3755  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.98 
 
 		 372 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0523363  normal  0.297865 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4031  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.98 
 
 		 372 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4358  Fic protein family  26.81 
 
 		 346 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.069593  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.41 
 
 		 333 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0970  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.79 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.952557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>