211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0267 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0267  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 387 aa  806    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0049  oxidoreductase domain protein  70.83 
 
 		 391 aa  583  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0595236  normal  0.22981 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2442  oxidoreductase domain-containing protein  63.39 
 
 		 342 aa  460  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5583  oxidoreductase  55.79 
 
 		 342 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6513  oxidoreductase domain protein  53.15 
 
 		 336 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6100  oxidoreductase domain protein  52.25 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207397  normal  0.764338 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4491  oxidoreductase-like  51.22 
 
 		 339 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3326  oxidoreductase domain-containing protein  49.24 
 
 		 338 aa  362  5.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1988  oxidoreductase domain-containing protein  44.87 
 
 		 391 aa  352  7e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0347113 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1648  oxidoreductase domain protein  49.71 
 
 		 360 aa  348  8e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4054  oxidoreductase domain protein  47.97 
 
 		 357 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0585  Oxidoreductase domain  48.84 
 
 		 362 aa  332  8e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01560  predicted dehydrogenase  45.35 
 
 		 362 aa  330  3e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2165  oxidoreductase domain protein  47.01 
 
 		 335 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.97582  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2507  oxidoreductase domain protein  46.11 
 
 		 335 aa  317  2e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.762014  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1594  oxidoreductase domain protein  44.28 
 
 		 359 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0600  oxidoreductase domain-containing protein  41.01 
 
 		 362 aa  288  8e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4492  oxidoreductase-like  42.52 
 
 		 342 aa  287  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3349  oxidoreductase domain protein  22.89 
 
 		 327 aa  98.6  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.773836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  24.8 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  25.2 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2113  oxidoreductase domain protein  29.36 
 
 		 344 aa  67  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  25.97 
 
 		 311 aa  62  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  28.07 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 		 327 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  28.97 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.32 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  26.78 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  26.71 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  27.54 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2078  oxidoreductase domain protein  23.37 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  27.46 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 		 346 aa  57  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10280  predicted dehydrogenase  28.79 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  29.37 
 
 		 346 aa  57  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0203744 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  27.46 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  27.46 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  27.46 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  27.46 
 
 		 346 aa  57  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  24.53 
 
 		 355 aa  57  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  27.46 
 
 		 359 aa  57  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4070  oxidoreductase domain protein  25.77 
 
 		 734 aa  56.6  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  28.97 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  24.81 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.75 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  27.66 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  27.66 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  26.21 
 
 		 331 aa  55.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  27.66 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0495  oxidoreductase domain-containing protein  20.07 
 
 		 328 aa  55.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0650214  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  25.87 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 344 aa  56.2  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  27.66 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  27.66 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  23.77 
 
 		 362 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0519  oxidoreductase domain-containing protein  20.07 
 
 		 328 aa  55.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00249264  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  24.73 
 
 		 360 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1238  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  25.35 
 
 		 369 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  28 
 
 		 346 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1283  oxidoreductase domain protein  18.88 
 
 		 328 aa  54.3  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0628466  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.6 
 
 		 347 aa  54.3  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  23.16 
 
 		 715 aa  54.7  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  23.05 
 
 		 403 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  26.67 
 
 		 310 aa  53.1  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2007  oxidoreductase  24.87 
 
 		 336 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0414834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  24.53 
 
 		 349 aa  52.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  25.37 
 
 		 333 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  24.21 
 
 		 373 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  24.62 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1882  oxidoreductase domain protein  25.27 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000416428  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  23.68 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0356  oxidoreductase domain-containing protein  22.26 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2234  oxidoreductase domain protein  24.38 
 
 		 354 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  24.88 
 
 		 329 aa  51.2  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4048  oxidoreductase domain-containing protein  24.14 
 
 		 346 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  26.21 
 
 		 435 aa  50.8  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  23.56 
 
 		 347 aa  50.8  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  22.4 
 
 		 438 aa  50.8  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  25.71 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  27.89 
 
 		 337 aa  50.8  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  25.16 
 
 		 363 aa  50.8  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4377  oxidoreductase domain protein  28.17 
 
 		 358 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0993293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2179  oxidoreductase domain protein  22.76 
 
 		 389 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000944475 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4267  oxidoreductase domain protein  28.17 
 
 		 358 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.944939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  23.64 
 
 		 496 aa  50.4  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  27.59 
 
 		 349 aa  50.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  27.59 
 
 		 349 aa  50.1  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  27.59 
 
 		 349 aa  50.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  25.93 
 
 		 484 aa  50.1  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2425  oxidoreductase domain-containing protein  24.81 
 
 		 389 aa  50.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  24.23 
 
 		 330 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  21.86 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.52 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  35.56 
 
 		 464 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06530  predicted dehydrogenase  24.22 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0363846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2322  oxidoreductase domain-containing protein  29.91 
 
 		 320 aa  49.3  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  22.56 
 
 		 344 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  24.01 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0358  oxidoreductase domain protein  21.9 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>