223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0141 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0141  methyltransferase type 11  100 
 
 		 233 aa  478  1e-134  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0212  hypothetical protein  80.95 
 
 		 231 aa  393  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  35.64 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0439  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.47 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.74 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.74 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3807  methyltransferase type 12  34.62 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  33.33 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  33.75 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  26.9 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0890  hypothetical protein  31.47 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1959  methyltransferase type 12  31.63 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21046 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2962  methyltransferase type 11  34 
 
 		 401 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  32.63 
 
 		 310 aa  53.1  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2248  hypothetical protein  40.74 
 
 		 226 aa  53.1  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.757359  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.69 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.69 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.04 
 
 		 280 aa  53.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.69 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  27.21 
 
 		 240 aa  52.8  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  34.44 
 
 		 711 aa  52  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.91 
 
 		 232 aa  52  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  35.56 
 
 		 710 aa  51.6  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 284 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 369 aa  51.6  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.91 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  25.69 
 
 		 390 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.65 
 
 		 330 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.91 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.69 
 
 		 239 aa  49.7  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4425  methyltransferase type 11  26.45 
 
 		 262 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102836  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  31.71 
 
 		 304 aa  49.7  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 253 aa  49.7  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  32.05 
 
 		 328 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 283 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1083  hypothetical protein  28.21 
 
 		 254 aa  48.9  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  24.21 
 
 		 280 aa  48.5  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  28.42 
 
 		 301 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  23.91 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.46 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.27 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  30.38 
 
 		 328 aa  47.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  31.71 
 
 		 309 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3415  magnesium protoporphyrin O-methyltransferase  27.5 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.762452  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.08 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0965  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  26.62 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.145121 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  32.1 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3899  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.33 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  29.27 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 283 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3215  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  27.01 
 
 		 320 aa  47.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.409549  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.27 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3033  methyltransferase type 11  29.21 
 
 		 304 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.34 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930008  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2263  Methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0372  hypothetical protein  30 
 
 		 1085 aa  46.6  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.47 
 
 		 345 aa  46.6  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  30.58 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18721  hypothetical protein  26.92 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  30.68 
 
 		 195 aa  47  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  23.16 
 
 		 352 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1258  hypothetical protein  30.86 
 
 		 238 aa  46.2  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.16 
 
 		 238 aa  46.2  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 		 252 aa  46.2  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  29.35 
 
 		 239 aa  45.8  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  29.59 
 
 		 221 aa  45.8  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 243 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1018  hypothetical protein  27.59 
 
 		 233 aa  45.8  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.891153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 243 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  26.97 
 
 		 210 aa  45.8  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 243 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2370  methyltransferase type 11  26.6 
 
 		 219 aa  45.8  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258532 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0491  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.2 
 
 		 229 aa  45.8  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372241  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4447  Methyltransferase type 11  26.56 
 
 		 219 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1389  methyltransferase type 12  32.17 
 
 		 2112 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768634 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 		 1312 aa  45.4  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1388  Methyltransferase type 11  28 
 
 		 194 aa  45.4  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  26.96 
 
 		 810 aa  45.4  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  34.34 
 
 		 194 aa  45.4  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  24.53 
 
 		 273 aa  45.4  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  28.95 
 
 		 206 aa  45.4  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  23.63 
 
 		 200 aa  45.4  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0182  Methyltransferase type 11  29.7 
 
 		 263 aa  45.1  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0334724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  24.66 
 
 		 201 aa  45.1  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.24 
 
 		 237 aa  45.1  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 243 aa  45.1  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.24 
 
 		 237 aa  45.1  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3665  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.85 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  30.59 
 
 		 295 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.11 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1078  SAM-dependent methyltransferase  25.21 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.215412  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  29.35 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>