278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1370 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1370  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  100 
 
 
441 aa  898    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3266  electron transfer protein (PduS)  67.12 
 
 
442 aa  588  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1302  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  47.51 
 
 
440 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0361  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  45.21 
 
 
451 aa  362  6e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3270  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  43.47 
 
 
445 aa  355  5.999999999999999e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4896  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  42.76 
 
 
442 aa  348  8e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0084  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  45.45 
 
 
449 aa  333  3e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2230  polyhedral body protein  41.47 
 
 
451 aa  324  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520726  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2389  polyhedral body protein  41.71 
 
 
451 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2176  polyhedral body protein  41.23 
 
 
451 aa  322  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1915  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  41.14 
 
 
444 aa  322  7e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2276  polyhedral body protein  41.23 
 
 
451 aa  322  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0189195 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2223  polyhedral body protein  41.71 
 
 
451 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0117098  normal  0.877989 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2055  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  41.1 
 
 
441 aa  308  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.551264  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2294  propanediol utilization protein PduS  40.86 
 
 
447 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1243  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  39.91 
 
 
449 aa  300  4e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1185  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  37.07 
 
 
442 aa  287  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0079  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  33.93 
 
 
443 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000481582  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0306  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  34.83 
 
 
454 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.521272  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0680  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  32.59 
 
 
435 aa  159  8e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0704  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  32.91 
 
 
435 aa  159  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0494  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  33.12 
 
 
440 aa  156  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0552147  hitchhiker  0.00321553 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1081  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  31.72 
 
 
441 aa  156  8e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0983161 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1327  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  32.54 
 
 
439 aa  151  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000291101  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1571  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  32.18 
 
 
438 aa  150  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1663  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  29.78 
 
 
436 aa  150  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02731  electron transport complex protein RnfC  34.6 
 
 
852 aa  149  8e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.618008  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14350  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  31.33 
 
 
441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000459992  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0688  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  30.99 
 
 
605 aa  147  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0508448  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_002950  PG0304  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  33.23 
 
 
443 aa  145  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.980459 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0065  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  32.07 
 
 
448 aa  144  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.791332  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19250  electron transport complex protein RnfC  31.44 
 
 
688 aa  144  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0838  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase, A subunit  30.5 
 
 
480 aa  143  6e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0144455  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0342  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  33.12 
 
 
445 aa  143  7e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2967  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  29.65 
 
 
890 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.390488  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1529  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  29.88 
 
 
441 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.427394  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0988  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  30.58 
 
 
441 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1310  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  29.66 
 
 
441 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1091  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  32.59 
 
 
437 aa  139  8.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.566886  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02966  electron transport complex protein RnfC  31.53 
 
 
912 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0211  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  29.41 
 
 
439 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.507749  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0699  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  30.03 
 
 
442 aa  138  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0387  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  30.79 
 
 
435 aa  137  4e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002947  electron transport complex protein RnfC  31.53 
 
 
916 aa  136  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.703595  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1733  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  29.68 
 
 
435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0269079  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1785  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  29.94 
 
 
567 aa  133  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0936  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  27.96 
 
 
609 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.787123  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01589  hypothetical protein  28.69 
 
 
694 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00945839  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1402  electron transport complex protein RnfC  29.05 
 
 
944 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.860812 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2430  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  30.09 
 
 
439 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.216673  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01599  electron transport complex protein RnfC  28.69 
 
 
740 aa  131  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0105357  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2012  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  28.69 
 
 
740 aa  131  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000275301  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1173  electron transport complex protein RnfC  30.97 
 
 
515 aa  131  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1570  electron transport complex protein RnfC  28.69 
 
 
676 aa  130  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133646  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2000  electron transport complex protein RnfC  28.69 
 
 
740 aa  131  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000227688  normal  0.287278 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1705  electron transport complex protein RnfC  28.69 
 
 
740 aa  131  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0365167  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1837  electron transport complex protein RnfC  28.69 
 
 
740 aa  131  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2991  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  31.73 
 
 
481 aa  130  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1555  electron transport complex protein RnfC  28.85 
 
 
732 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.555385  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1885  electron transport complex protein RnfC  28.85 
 
 
704 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1818  electron transport complex protein RnfC  28.41 
 
 
708 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.243946  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2341  electron transport complex protein RnfC  28.41 
 
 
772 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288695  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1567  electron transport complex protein RnfC  28.85 
 
 
735 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0379557 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1627  electron transport complex protein RnfC  28.85 
 
 
735 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0777449  normal  0.304577 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1717  electron transport complex protein RnfC  28.85 
 
 
735 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1792  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  29.43 
 
 
541 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273011 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0263  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfC  31.37 
 
 
437 aa  128  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0974  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  26.41 
 
 
438 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4547  electron transport complex protein RnfC  30.39 
 
 
884 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2261  electron transport complex protein RnfC  30.39 
 
 
884 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0443736  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1061  electron transport complex protein RnfC  29.17 
 
 
659 aa  126  7e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1848  electron transport complex protein RnfC  30.77 
 
 
793 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00264282  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2628  electron transport complex protein RnfC  28.25 
 
 
532 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0539  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  29.35 
 
 
438 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2170  electron transport complex protein RnfC  29.79 
 
 
788 aa  125  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0332538  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2110  electron transport complex protein RnfC  30.03 
 
 
888 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.524779  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2355  electron transport complex protein RnfC  31.06 
 
 
825 aa  123  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2401  electron transport complex protein RnfC  28.93 
 
 
745 aa  124  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2895  electron transport complex protein RnfC  26.81 
 
 
523 aa  123  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.473495  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1909  electron transport complex protein RnfC  29.2 
 
 
799 aa  123  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.567258  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1819  electron transport complex protein RnfC  26.98 
 
 
673 aa  123  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000614228 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2066  electron transport complex protein RnfC  28.91 
 
 
809 aa  123  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00275367  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2275  electron transport complex protein RnfC  30.11 
 
 
876 aa  123  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0169634  normal  0.804532 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1034  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  27.78 
 
 
704 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.321702  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0610  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  27.59 
 
 
440 aa  122  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0321334  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2063  electron transport complex protein RnfC  30.11 
 
 
885 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00525621  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2068  electron transport complex protein RnfC  26.97 
 
 
870 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.583585  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1155  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  28.76 
 
 
441 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.47563 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2023  electron transport complex protein RnfC  27.75 
 
 
747 aa  120  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3933  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  31.23 
 
 
517 aa  120  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00505107  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3194  4Fe-4S ferredoxin, RnfC  31.86 
 
 
517 aa  120  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2510  electron transport complex protein RnfC  28.57 
 
 
790 aa  119  9e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2323  electron transport complex protein RnfC  27.75 
 
 
737 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3194  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  30.91 
 
 
519 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0106168  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2558  electron transport complex protein RnfC  27.89 
 
 
784 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0669031 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0814  electron transport complex protein RnfC  28.03 
 
 
515 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.338019 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2174  electron transport complex protein RnfC  30.33 
 
 
846 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.234957  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2017  electron transport complex protein RnfC  29.71 
 
 
558 aa  117  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1865  electron transport complex protein RnfC  28.38 
 
 
731 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0536  electron transport complex protein RnfC  29.65 
 
 
773 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000392819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>