More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1068 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1068  ABC transporter related  100 
 
 		 273 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711539  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  61.9 
 
 		 259 aa  326  3e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  63.39 
 
 		 260 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  56.8 
 
 		 271 aa  290  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  54.65 
 
 		 265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  52.11 
 
 		 265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  53.88 
 
 		 264 aa  280  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  51.85 
 
 		 284 aa  277  1e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  53.82 
 
 		 263 aa  277  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.96 
 
 		 254 aa  276  4e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  53.2 
 
 		 254 aa  275  6e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  53.57 
 
 		 255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  51.11 
 
 		 284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  52.38 
 
 		 259 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  55.02 
 
 		 276 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2499  ABC transporter related  56.52 
 
 		 264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.513432  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  51.95 
 
 		 255 aa  269  4e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  52.38 
 
 		 259 aa  268  5.9999999999999995e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  51.45 
 
 		 288 aa  268  8.999999999999999e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  52.21 
 
 		 270 aa  267  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  49.4 
 
 		 252 aa  266  4e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0483  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  49.61 
 
 		 261 aa  265  8e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  51.98 
 
 		 257 aa  264  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  49.6 
 
 		 256 aa  264  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  52.19 
 
 		 259 aa  264  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  53.41 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  52.14 
 
 		 262 aa  263  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  49.42 
 
 		 270 aa  262  4e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  54.15 
 
 		 262 aa  261  6e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  51.41 
 
 		 270 aa  261  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  51.59 
 
 		 261 aa  260  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  51.41 
 
 		 270 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  51.98 
 
 		 255 aa  260  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  51.97 
 
 		 261 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  51 
 
 		 256 aa  257  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  54.22 
 
 		 261 aa  256  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.6 
 
 		 255 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  52.17 
 
 		 257 aa  257  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.6 
 
 		 255 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  54.12 
 
 		 261 aa  255  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  50.79 
 
 		 257 aa  255  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.2 
 
 		 255 aa  255  7e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2014  ABC transporter related  51.39 
 
 		 263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  52.12 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1894  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  51.39 
 
 		 286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0274473  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.2 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  50.79 
 
 		 255 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  51.2 
 
 		 271 aa  252  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  52.26 
 
 		 255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1727  ABC transporter related  54 
 
 		 257 aa  252  6e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4111  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.2 
 
 		 255 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277717  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  49 
 
 		 252 aa  251  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1163  ABC transporter related  49.4 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0565  ABC transporter related  49.6 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0274891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4413  ABC transporter related  50.2 
 
 		 271 aa  249  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0536  ABC transporter related  49.6 
 
 		 281 aa  249  4e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.508685  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  50.21 
 
 		 260 aa  249  4e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  50.21 
 
 		 260 aa  249  4e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  50.94 
 
 		 280 aa  249  5e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4429  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.8 
 
 		 257 aa  248  7e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108866 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1384  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.77 
 
 		 255 aa  248  8e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818364  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  51.64 
 
 		 258 aa  248  9e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  51.61 
 
 		 258 aa  247  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2141  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49 
 
 		 257 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0558111  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.21 
 
 		 258 aa  247  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0654  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.8 
 
 		 257 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0775  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49 
 
 		 257 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0865  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49 
 
 		 257 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154557  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4944  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.8 
 
 		 257 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.956348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3848  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.4 
 
 		 255 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2316  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.61 
 
 		 261 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  50.82 
 
 		 256 aa  247  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50550  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.18 
 
 		 255 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.013767 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  50.82 
 
 		 268 aa  247  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  51.85 
 
 		 258 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1873  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.88 
 
 		 263 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.188258 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4923  ABC transporter related  49.6 
 
 		 264 aa  246  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000671765  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  51.94 
 
 		 271 aa  246  3e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  51.85 
 
 		 258 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  51.85 
 
 		 258 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4306  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.18 
 
 		 255 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  50.81 
 
 		 258 aa  245  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  48.8 
 
 		 257 aa  245  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  48.8 
 
 		 259 aa  245  6e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3351  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.4 
 
 		 257 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  49.4 
 
 		 258 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5016  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.4 
 
 		 257 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.836649 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5271  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.4 
 
 		 257 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.878512  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.4 
 
 		 256 aa  244  8e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19620  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.6 
 
 		 255 aa  244  8e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00232655  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0463  ABC transporter related protein  47.2 
 
 		 252 aa  244  9e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  48.8 
 
 		 307 aa  244  9e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03304  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  48.8 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0260  ABC transporter related protein  48.8 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  48.8 
 
 		 257 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  48.61 
 
 		 259 aa  244  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3653  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.8 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.8 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03257  hypothetical protein  48.8 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3737  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.8 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>