More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3596 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  100 
 
 
390 aa  803    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  71.47 
 
 
390 aa  585  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  69.92 
 
 
390 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2987  aminotransferase class I and II  65.64 
 
 
393 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2245  aminotransferase class I and II  59.79 
 
 
397 aa  479  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.154581  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0079  aminotransferase class I and II  57.58 
 
 
392 aa  479  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  48.47 
 
 
400 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  48.47 
 
 
400 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  47.96 
 
 
400 aa  355  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  42.82 
 
 
390 aa  352  5e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  46.84 
 
 
401 aa  352  5e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  45.83 
 
 
392 aa  350  2e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  46.15 
 
 
389 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  44.1 
 
 
388 aa  348  1e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6064  aspartate aminotransferase  47.07 
 
 
402 aa  345  8e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  43.59 
 
 
387 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0566  aspartate aminotransferase  47.07 
 
 
402 aa  342  5.999999999999999e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  44.27 
 
 
405 aa  340  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  41.22 
 
 
395 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  42.49 
 
 
397 aa  339  4e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07871  aminotransferase class-I  43.41 
 
 
393 aa  338  9e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.404062  hitchhiker  0.00724094 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  43.65 
 
 
398 aa  337  2.9999999999999997e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  42.03 
 
 
399 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  41.52 
 
 
399 aa  334  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  44.85 
 
 
392 aa  334  2e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03600  aspartate aminotransferase  43 
 
 
411 aa  333  3e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  44.53 
 
 
406 aa  333  4e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  44.67 
 
 
402 aa  332  6e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  46.17 
 
 
400 aa  332  8e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  45.15 
 
 
400 aa  332  9e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  45.15 
 
 
400 aa  332  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  44.62 
 
 
388 aa  331  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07311  aminotransferases class-I  43.22 
 
 
392 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.719619  hitchhiker  0.00557892 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  43.22 
 
 
392 aa  331  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  44.64 
 
 
400 aa  328  7e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  44.67 
 
 
400 aa  328  7e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  44.53 
 
 
400 aa  328  7e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0353  aminotransferase class I and II  47.95 
 
 
391 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.818092  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  41.48 
 
 
397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  45.94 
 
 
400 aa  327  3e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  44.39 
 
 
400 aa  326  3e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  45.62 
 
 
400 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  44.39 
 
 
400 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  45.43 
 
 
400 aa  326  5e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  44.13 
 
 
400 aa  326  5e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  43.51 
 
 
400 aa  325  8.000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  45.88 
 
 
401 aa  325  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  44.81 
 
 
383 aa  325  1e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6643  aspartate aminotransferase  44.78 
 
 
413 aa  324  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  43.59 
 
 
388 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3164  aspartate aminotransferase  44.7 
 
 
460 aa  323  4e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.808038  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  43.59 
 
 
388 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  44.39 
 
 
400 aa  322  8e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  39.95 
 
 
397 aa  322  9.000000000000001e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  42.01 
 
 
393 aa  321  9.999999999999999e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  44.94 
 
 
401 aa  321  9.999999999999999e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  40.62 
 
 
397 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  45.15 
 
 
400 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  39.12 
 
 
397 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  44.9 
 
 
400 aa  320  3e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  38.86 
 
 
397 aa  320  3e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  44.64 
 
 
400 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  43.8 
 
 
400 aa  319  5e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  42.86 
 
 
400 aa  319  6e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  44.9 
 
 
400 aa  318  7e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  44.53 
 
 
393 aa  318  7e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  41.69 
 
 
395 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1620  aspartate aminotransferase  43.4 
 
 
401 aa  318  1e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.83573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  41.43 
 
 
395 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  41.43 
 
 
395 aa  318  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  41.43 
 
 
395 aa  318  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  41.43 
 
 
395 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  41.15 
 
 
387 aa  318  1e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  41.43 
 
 
395 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  44.64 
 
 
400 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  44.64 
 
 
400 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  41.18 
 
 
395 aa  317  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  44.13 
 
 
402 aa  317  2e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  41.48 
 
 
395 aa  317  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  44.99 
 
 
400 aa  318  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  43.19 
 
 
400 aa  317  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  41.18 
 
 
395 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  45.36 
 
 
404 aa  317  3e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07271  aminotransferases class-I  40.36 
 
 
392 aa  317  3e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.232753  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  41.48 
 
 
395 aa  316  5e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  42.35 
 
 
398 aa  316  5e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21060  aspartate aminotransferase  41.98 
 
 
410 aa  316  6e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  43.88 
 
 
400 aa  316  6e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0907  aspartate aminotransferase  43.77 
 
 
415 aa  316  6e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.149386 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  42.27 
 
 
392 aa  315  7e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  44.39 
 
 
401 aa  315  8e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0535  aminotransferase class I and II  43.51 
 
 
401 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169316  normal  0.0112885 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  43.47 
 
 
400 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  39.33 
 
 
389 aa  315  9.999999999999999e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07291  aminotransferases class-I  39.85 
 
 
392 aa  314  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.122313  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  42.71 
 
 
395 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0525  aspartate aminotransferase  40.46 
 
 
397 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  43.62 
 
 
400 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  42.75 
 
 
414 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2022  aspartate aminotransferase  41.88 
 
 
393 aa  313  2.9999999999999996e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.776343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>