More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2996 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2996  cysteine sulfinate desulfinase  100 
 
 		 401 aa  820    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3180  cysteine sulfinate desulfinase  72.07 
 
 		 401 aa  607  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0925  cysteine sulfinate desulfinase  67.58 
 
 		 401 aa  557  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.002092  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3379  cysteine sulfinate desulfinase  68.08 
 
 		 401 aa  556  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3807  cysteine sulfinate desulfinase  66.33 
 
 		 401 aa  542  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000833089  hitchhiker  0.000000586556 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3060  cysteine sulfinate desulfinase  63.84 
 
 		 401 aa  522  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000299944  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02661  cysteine sulfinate desulfinase  63.59 
 
 		 401 aa  519  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0878  cysteine desulfurase, catalytic subunit CsdA  63.59 
 
 		 401 aa  519  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.667139  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2951  cysteine sulfinate desulfinase  63.59 
 
 		 401 aa  519  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00101745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4075  cysteine sulfinate desulfinase  63.59 
 
 		 401 aa  519  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.023337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3116  cysteine sulfinate desulfinase  63.59 
 
 		 401 aa  518  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000009707  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0902  cysteine sulfinate desulfinase  63.59 
 
 		 401 aa  519  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3256  cysteine sulfinate desulfinase  63.59 
 
 		 401 aa  520  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02622  hypothetical protein  63.59 
 
 		 401 aa  519  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0998  cysteine sulfinate desulfinase  62.34 
 
 		 401 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000110695  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1050  cysteine sulfinate desulfinase  62.09 
 
 		 401 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2954  cysteine sulfinate desulfinase  63.34 
 
 		 401 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000519632  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3222  cysteine sulfinate desulfinase  62.09 
 
 		 401 aa  514  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000462422  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3310  cysteine sulfinate desulfinase  63.84 
 
 		 401 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.04923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3147  cysteine sulfinate desulfinase  63.59 
 
 		 401 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.148622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3130  cysteine sulfinate desulfinase  63.84 
 
 		 401 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00396808  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3195  cysteine sulfinate desulfinase  63.84 
 
 		 401 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.364366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3210  cysteine sulfinate desulfinase  63.84 
 
 		 401 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  53.23 
 
 		 404 aa  435  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  52.74 
 
 		 403 aa  437  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03290  hypothetical protein  52.74 
 
 		 403 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0690  cysteine desulfurase  47.9 
 
 		 405 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144442  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.55 
 
 		 418 aa  372  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.65 
 
 		 451 aa  360  3e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.36 
 
 		 404 aa  355  1e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  42.93 
 
 		 419 aa  354  1e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  42.22 
 
 		 420 aa  348  7e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.23 
 
 		 605 aa  347  3e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.5 
 
 		 408 aa  345  8e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  44.96 
 
 		 417 aa  345  8e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.56 
 
 		 429 aa  345  8.999999999999999e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.31 
 
 		 429 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.31 
 
 		 429 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  44.42 
 
 		 414 aa  342  7e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.67 
 
 		 429 aa  339  4e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  42.79 
 
 		 405 aa  339  5e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  43.72 
 
 		 604 aa  339  5e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  43.7 
 
 		 420 aa  339  5.9999999999999996e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.13 
 
 		 412 aa  339  5.9999999999999996e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  43.72 
 
 		 604 aa  338  7e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.78 
 
 		 416 aa  338  8e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.05 
 
 		 417 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0967  cysteine desulfurase, aminotransferase, class V  46.08 
 
 		 399 aa  338  9.999999999999999e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  42.79 
 
 		 405 aa  338  9.999999999999999e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.53 
 
 		 414 aa  336  2.9999999999999997e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.36 
 
 		 657 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  43.11 
 
 		 425 aa  336  3.9999999999999995e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.91 
 
 		 417 aa  336  5e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.47 
 
 		 662 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  40.6 
 
 		 414 aa  335  5.999999999999999e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.22 
 
 		 413 aa  335  1e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  46.12 
 
 		 414 aa  335  1e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2211  putative selenocysteine lyase  40.14 
 
 		 569 aa  333  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.686434  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  43.36 
 
 		 661 aa  333  4e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  43.48 
 
 		 404 aa  333  5e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.23 
 
 		 412 aa  332  6e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.75 
 
 		 414 aa  331  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.03 
 
 		 406 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.07 
 
 		 413 aa  330  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.31 
 
 		 421 aa  330  2e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.95 
 
 		 415 aa  330  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  43 
 
 		 422 aa  330  4e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.53 
 
 		 406 aa  330  4e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.43 
 
 		 414 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  40.2 
 
 		 404 aa  329  6e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5203  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.05 
 
 		 941 aa  328  8e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.93 
 
 		 413 aa  328  9e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  43.61 
 
 		 682 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  44.03 
 
 		 688 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  42.93 
 
 		 413 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.45 
 
 		 408 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.68 
 
 		 420 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.93 
 
 		 425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.18 
 
 		 407 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.95 
 
 		 427 aa  327  3e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.18 
 
 		 407 aa  327  3e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.89 
 
 		 608 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.86 
 
 		 678 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.05 
 
 		 419 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.8 
 
 		 419 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  41.69 
 
 		 414 aa  324  2e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.7 
 
 		 415 aa  324  2e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  42.89 
 
 		 665 aa  324  2e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  44.55 
 
 		 406 aa  323  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.44 
 
 		 664 aa  322  5e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.65 
 
 		 404 aa  322  5e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.1 
 
 		 674 aa  322  5e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  44.17 
 
 		 406 aa  322  6e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.1 
 
 		 672 aa  322  6e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  40.25 
 
 		 420 aa  322  8e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.65 
 
 		 408 aa  322  9.000000000000001e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4450  aminotransferase class V  44.89 
 
 		 405 aa  321  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.728371  hitchhiker  0.000499767 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  41.44 
 
 		 414 aa  321  9.999999999999999e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  41.38 
 
 		 423 aa  322  9.999999999999999e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.22 
 
 		 644 aa  322  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>