More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1018 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
535 aa  1061    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2834  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.19 
 
 
520 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.95 
 
 
561 aa  348  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.69 
 
 
561 aa  335  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.835608  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0782  iron-uptake permease inner membrane protein  36.21 
 
 
555 aa  295  2e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.297135  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03434  hypothetical protein  33.58 
 
 
541 aa  290  5.0000000000000004e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002575  ferric iron ABC transporter permease protein  32.9 
 
 
541 aa  286  7e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.500484  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
544 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.49 
 
 
544 aa  279  8e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.3 
 
 
544 aa  278  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0743  iron(III) ABC transporter, permease protein  37.05 
 
 
544 aa  276  5e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2587  iron(III) ABC transporter, permease protein  33.83 
 
 
543 aa  276  9e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.14 
 
 
544 aa  272  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.81 
 
 
543 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.99 
 
 
543 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0138  iron(III) ABC transporter, permease protein  34.88 
 
 
541 aa  270  5.9999999999999995e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000182315  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
543 aa  269  7e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.81 
 
 
543 aa  269  8e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 
543 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.25371  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.12 
 
 
543 aa  265  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0845  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.89 
 
 
543 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 
562 aa  249  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00794358  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.17 
 
 
543 aa  237  4e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.744333  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3006  iron(III) ABC transporter, inner membrane binding component  32.52 
 
 
543 aa  236  7e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.525048  normal  0.629796 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.47 
 
 
554 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104442 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0667  iron(III) ABC transporter, permease protein  35.38 
 
 
542 aa  228  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603449  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 
589 aa  223  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0166577  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0768  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.89 
 
 
558 aa  212  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
543 aa  208  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
559 aa  208  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.21 
 
 
528 aa  207  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.87 
 
 
562 aa  205  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0177  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33 
 
 
553 aa  197  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.445803 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1013  iron(III) ABC transporter, permease protein  31.78 
 
 
542 aa  197  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0312612  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3626  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
562 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 
557 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2023  putative ABC transporter permease component  30.48 
 
 
559 aa  193  8e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.967123  normal  0.0816083 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0163  putative iron(III) ABC transporter, fused inner membrane subunits  31.88 
 
 
557 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.89 
 
 
557 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.406299 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
558 aa  192  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0921183  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0441  putative iron ABC transporter, permease protein  25.09 
 
 
533 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.388151  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0894  ABC-type transport system, permease component  29.72 
 
 
553 aa  188  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000205423  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.95 
 
 
550 aa  187  6e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.7 
 
 
560 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.7 
 
 
560 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.73 
 
 
555 aa  186  7e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
568 aa  186  8e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0287363 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0731  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.22 
 
 
567 aa  183  8.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0677887  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1198  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.19 
 
 
545 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4317  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  33.26 
 
 
562 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.946485  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1546  ABC iron transporter, inner membrane subunit  27.88 
 
 
564 aa  180  7e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.424688  normal  0.358419 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.69 
 
 
550 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.07 
 
 
561 aa  179  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0551  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
567 aa  179  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.44 
 
 
549 aa  178  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217598  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.48 
 
 
574 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00284173  normal  0.308977 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.18 
 
 
558 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.57 
 
 
566 aa  177  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0167  iron ABC transporter, permease protein  26.98 
 
 
538 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.471521  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 
569 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0210  iron ABC transporter, permease protein  26.98 
 
 
538 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.912172  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0188  iron ABC transporter, permease protein  27.25 
 
 
538 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 
565 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.086066  normal  0.404722 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 
562 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 
562 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193935  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.57 
 
 
546 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677105  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0245  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.52 
 
 
538 aa  170  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0116  iron ABC transporter, permease protein  25 
 
 
518 aa  169  9e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.78 
 
 
562 aa  169  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5429  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.87 
 
 
555 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 
582 aa  169  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.44 
 
 
550 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.714891  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.79 
 
 
556 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
558 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.867638  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0972  ABC transporter, permease protein  25.52 
 
 
521 aa  167  4e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.200041  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0654  putative iron compound ABC transporter, permease protein  28.52 
 
 
589 aa  167  5e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0699  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  28.34 
 
 
589 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0315  iron ABC transporter, permease protein  31.87 
 
 
538 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 
540 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1407  iron(III) ABC transporter permease protein  30.36 
 
 
543 aa  165  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.960253  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0154  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  24.86 
 
 
539 aa  164  3e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.234714  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
540 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.497984  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.98 
 
 
538 aa  164  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 
550 aa  164  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5195  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 
540 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154251  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.58 
 
 
570 aa  163  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.931275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47290  iron ABC transporter, permease protein  31.24 
 
 
538 aa  162  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.66 
 
 
565 aa  162  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.91 
 
 
550 aa  162  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.34 
 
 
533 aa  162  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0400876  hitchhiker  0.00000113394 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.67 
 
 
550 aa  160  8e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1086  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  32.8 
 
 
537 aa  159  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0627079  normal  0.556717 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.34 
 
 
506 aa  156  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.48497  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1136  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  24.47 
 
 
532 aa  154  5e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1377  iron ABC transporter permease  32.37 
 
 
570 aa  154  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300501  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.12 
 
 
542 aa  151  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.85 
 
 
552 aa  150  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.778216  normal  0.173328 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.85 
 
 
544 aa  150  5e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.553372  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0689  iron ABC transporter permease  32.23 
 
 
570 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000577033  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1181  iron ABC transporter permease  32.23 
 
 
570 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.881727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>