41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1736 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1736  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 
152 aa  318  1.9999999999999998e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1006  protein of unknown function UPF0153  58.87 
 
 
156 aa  170  6.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0180837 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  52 
 
 
151 aa  163  9e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1303  hypothetical protein  50.34 
 
 
168 aa  159  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  54.61 
 
 
175 aa  157  7e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  52.48 
 
 
149 aa  154  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  38.39 
 
 
156 aa  100  9e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  37.14 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  36.79 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1438  hypothetical protein  33.04 
 
 
124 aa  57  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.903885  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0012  hypothetical protein  31.73 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  36.96 
 
 
172 aa  55.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0604  hypothetical protein  32.14 
 
 
124 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0097  hypothetical protein  33.66 
 
 
140 aa  54.3  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.348391  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0924  conserved hypothetical protein (UPF0153 domain protein)  33.04 
 
 
122 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0517  hypothetical protein  32.14 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0599  hypothetical protein  32.63 
 
 
113 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000657339  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  27.03 
 
 
271 aa  53.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0471  hypothetical protein  33.08 
 
 
221 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0626  hypothetical protein  32.58 
 
 
110 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000851469  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1540  hypothetical protein  30.25 
 
 
148 aa  50.8  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  27.78 
 
 
170 aa  50.4  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  34.12 
 
 
222 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0729  hypothetical protein  28.18 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121863  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1308  protein of unknown function UPF0153  31.53 
 
 
126 aa  47.4  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0836472  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_567  hypothetical protein  30.53 
 
 
113 aa  47.4  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1546  protein of unknown function UPF0153  31.68 
 
 
186 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2472  hypothetical protein  32.22 
 
 
167 aa  46.2  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1893  protein of unknown function UPF0153  30.59 
 
 
117 aa  45.1  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0146  hypothetical protein  28.21 
 
 
121 aa  43.9  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0057515  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2888  hypothetical protein  30.12 
 
 
112 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1550  hypothetical protein  28.05 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0177  hypothetical protein  23.36 
 
 
224 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0467  hypothetical protein  28.05 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0193429  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1656  protein of unknown function UPF0153  26.04 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  30 
 
 
194 aa  42.4  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0442  hypothetical protein  25.3 
 
 
163 aa  42.4  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00675545  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1385  reductive dehalogenase associated protein  29.59 
 
 
181 aa  41.2  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1904  hypothetical protein  28.46 
 
 
222 aa  41.6  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0785704  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0369  hypothetical protein  26.83 
 
 
163 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0145545 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0484  hypothetical protein  26.83 
 
 
164 aa  40.8  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>