49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0524 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0524  regulatory protein, FmdB family  100 
 
 		 80 aa  160  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2620  hypothetical protein  55.32 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1274  FmdB family regulatory protein  56.52 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3203  hypothetical protein  41.25 
 
 		 77 aa  57  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0583  regulatory protein, FmdB family  46.3 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301653 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1286  regulatory protein, FmdB family  46.25 
 
 		 76 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497457  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1995  FmdB family regulatory protein  52 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.013154  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3061  FmdB family regulatory protein  37.5 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000726453  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1403  regulatory protein, FmdB family  39.58 
 
 		 85 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  39.58 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2310  regulatory protein, FmdB family  41.46 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1891  FmdB family regulatory protein  43.14 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00708289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1459  hypothetical protein  42.5 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501931 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1432  hypothetical protein  44 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1142  regulatory protein, FmdB family  44 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1552  hypothetical protein  44 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0687  regulatory protein, FmdB family  48.78 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.406646  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3407  FmdB family regulatory protein  43.18 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200356  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7750  FmdB family regulatory protein  40 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.572116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1521  FmdB family regulatory protein  43.18 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10251 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1219  regulatory protein, FmdB family  46.34 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778963 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1501  hypothetical protein  46.34 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0912  hypothetical protein  42 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  2.32009e-16  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2706  FmdB family regulatory protein  33.33 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.589032 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2482  FmdB family regulatory protein  40.91 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416517  normal  0.0908176 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2352  FmdB family regulatory protein  43.9 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1427  FmdB family regulatory protein  36.59 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0773  regulatory protein, FmdB family  36.25 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3239  regulatory protein, FmdB family  40.91 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.688496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0601  type I antifreeze protein  46 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1775  FmdB family regulatory protein  46.51 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2673  regulatory protein, FmdB family  39.22 
 
 		 66 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0890211  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2782  FmdB family regulatory protein  42 
 
 		 63 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155022  normal  0.0575706 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3238  hypothetical protein  41.46 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.882851  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2577  regulatory protein, FmdB family  39.22 
 
 		 66 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.923683  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4303  FmdB family regulatory protein  39.02 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0229  FmdB family regulatory protein  42 
 
 		 99 aa  41.2  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0778  regulatory protein, FmdB family  40 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0863  hypothetical protein  38.1 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.574225  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0746  hypothetical protein  40 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  44 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5314  regulatory protein, FmdB family  39.02 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4703  hypothetical protein  39.02 
 
 		 75 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0637  regulatory protein, FmdB family  33.33 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1172  FmdB family regulatory protein  36.62 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0644  hypothetical protein  33.33 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0721  FmdB family regulatory protein  31.65 
 
 		 164 aa  40  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.538439  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2275  regulatory protein, FmdB family  35.29 
 
 		 66 aa  40  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>