More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1559 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1559  TGS domain-containing protein  100 
 
 
311 aa  628  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.397282  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  51.54 
 
 
324 aa  340  2.9999999999999998e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2526  TGS domain-containing protein  42.86 
 
 
328 aa  261  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00530169  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0191  TGS domain-containing protein  42.51 
 
 
329 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.230896 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0638  small GTP-binding protein  40.96 
 
 
328 aa  245  8e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1762  GTP-binding protein HSR1-related  40.55 
 
 
330 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2114  GTP-binding protein, HSR1-related  40.55 
 
 
330 aa  225  8e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1842  TGS domain protein  40.24 
 
 
330 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.2616  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0581  TGS domain-containing protein  28.68 
 
 
389 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0662  TGS domain-containing protein  32.66 
 
 
357 aa  126  4.0000000000000003e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00027327  normal  0.0103543 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0697  TGS domain-containing protein  27.65 
 
 
387 aa  123  5e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0678  TGS domain-containing protein  29.69 
 
 
377 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0982  TGS domain-containing protein  27.44 
 
 
380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.741056 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0093  TGS domain-containing protein  27.76 
 
 
346 aa  110  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0617741  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1670  TGS domain-containing protein  27.34 
 
 
387 aa  107  3e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00970961 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  24.52 
 
 
364 aa  102  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1844  TGS domain-containing protein  36.09 
 
 
389 aa  99.8  5e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  25.48 
 
 
368 aa  94.4  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0958  small GTP-binding protein  25.97 
 
 
365 aa  88.2  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  22.16 
 
 
367 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0194  TGS domain protein  37.89 
 
 
351 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0728  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.32 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.199071 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.61 
 
 
370 aa  78.2  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  32.12 
 
 
435 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2277  small GTP-binding protein  29.6 
 
 
350 aa  77  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.92801  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35696  predicted protein  32.93 
 
 
410 aa  75.5  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0469  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.53 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.33 
 
 
417 aa  75.1  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  41.57 
 
 
369 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  31.61 
 
 
435 aa  74.3  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  30.86 
 
 
369 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  30.39 
 
 
368 aa  73.6  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  32 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  30.25 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  30.25 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.26 
 
 
425 aa  72.4  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1848  small GTP-binding protein  36.46 
 
 
371 aa  72  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  31.4 
 
 
370 aa  72  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  25.99 
 
 
363 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  36.84 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.06 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  35.76 
 
 
424 aa  70.1  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1571  GTP-binding protein HSR1-related protein  31.36 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  31.18 
 
 
427 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  30.25 
 
 
370 aa  68.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1159  GTP-binding protein HSR1-related  36.51 
 
 
322 aa  68.9  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  31.65 
 
 
371 aa  68.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  36.27 
 
 
370 aa  67.8  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  32.4 
 
 
428 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  32.75 
 
 
428 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  32.75 
 
 
428 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  32.75 
 
 
428 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  32.75 
 
 
428 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  31.58 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  32.75 
 
 
428 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  32.75 
 
 
428 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  34.71 
 
 
422 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2285  GTPase ObgE  32.2 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.397881  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1246  GTP-binding proten HflX  25.47 
 
 
356 aa  66.6  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  32.16 
 
 
428 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4091  GTPase ObgE  29.51 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  32.16 
 
 
428 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42651  Mitochondrial GTPase 2  30.77 
 
 
488 aa  66.2  0.0000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  32.16 
 
 
428 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  29.8 
 
 
439 aa  66.2  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3556  GTP-binding protein HSR1-related protein  32.54 
 
 
329 aa  66.2  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  28.8 
 
 
338 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03250  cytoplasm protein, putative  27.68 
 
 
367 aa  65.9  0.0000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.594558  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf270  GTPase ObgE  27.88 
 
 
422 aa  65.1  0.000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.320591  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  31.12 
 
 
327 aa  65.1  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  29.13 
 
 
583 aa  64.7  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  32.67 
 
 
369 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  28.74 
 
 
440 aa  64.7  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  33.33 
 
 
368 aa  64.7  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51277  predicted protein  28.48 
 
 
373 aa  64.3  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  33.68 
 
 
419 aa  64.3  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0267  hypothetical protein  25 
 
 
334 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.757423 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.87 
 
 
458 aa  62  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2164  GTP-binding protein  26.82 
 
 
333 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.311194  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  28.94 
 
 
343 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1748  GTPase ObgE  28.22 
 
 
382 aa  61.2  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0657373  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  32.71 
 
 
370 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  29.78 
 
 
428 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1590  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.89 
 
 
491 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00877411  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3835  GTP-binding protein Obg/CgtA  26.32 
 
 
346 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2411  small GTP-binding protein  23.79 
 
 
413 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000356758  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  29.84 
 
 
437 aa  61.6  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  31.87 
 
 
353 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  38.89 
 
 
500 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  28.95 
 
 
435 aa  60.8  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0758  GTPase ObgE  38.89 
 
 
476 aa  60.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.639245  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  28.81 
 
 
338 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7269  GTPase ObgE  28.25 
 
 
450 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564658  normal  0.11435 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0708  small GTP-binding protein  32.34 
 
 
346 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2448  GTP-binding protein HflX  26.09 
 
 
535 aa  60.1  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382552 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2297  GTP-binding protein HSR1-related  35.16 
 
 
328 aa  60.1  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.754733 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50671  predicted protein  26.79 
 
 
407 aa  60.5  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0546  GTP-binding protein HSR1-related  33.61 
 
 
329 aa  60.1  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.21 
 
 
437 aa  60.1  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1222  GTPase ObgE  32.04 
 
 
529 aa  59.3  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>