238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1107 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  100 
 
 
282 aa  565  1e-160  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  42.39 
 
 
279 aa  224  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  47.27 
 
 
287 aa  217  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  41.52 
 
 
282 aa  206  5e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  39.58 
 
 
283 aa  202  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  41.28 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  37.37 
 
 
299 aa  190  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  39.02 
 
 
280 aa  190  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  39.5 
 
 
279 aa  190  2e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  43.77 
 
 
277 aa  188  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  39.86 
 
 
281 aa  186  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  36.52 
 
 
281 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  39.64 
 
 
279 aa  186  3e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  39.64 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  42.05 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  40 
 
 
279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  36.36 
 
 
282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  39.5 
 
 
280 aa  181  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  38.79 
 
 
279 aa  179  4e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  36.79 
 
 
280 aa  179  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  39.36 
 
 
280 aa  177  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  36.07 
 
 
280 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  35.36 
 
 
287 aa  176  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  35.71 
 
 
280 aa  176  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  35.71 
 
 
280 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  35.71 
 
 
287 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  35.71 
 
 
287 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  38.43 
 
 
279 aa  176  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  36.07 
 
 
280 aa  176  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  35.61 
 
 
281 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  35 
 
 
280 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  40.73 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  39.64 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  40.73 
 
 
279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  39.57 
 
 
282 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  35.46 
 
 
282 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  35.46 
 
 
282 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  34.05 
 
 
280 aa  170  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  37.55 
 
 
281 aa  169  4e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3520  degV family protein  38.27 
 
 
282 aa  169  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350959  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  33.56 
 
 
283 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  37.77 
 
 
637 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  37.55 
 
 
281 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  34.64 
 
 
280 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  32.97 
 
 
280 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  32.27 
 
 
280 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  36.27 
 
 
283 aa  166  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  32.27 
 
 
280 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  33.57 
 
 
280 aa  166  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  34.98 
 
 
286 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  34.63 
 
 
286 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  32.87 
 
 
283 aa  165  9e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  34.63 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  32.62 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  34.63 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  32.62 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  34.63 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  32.62 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  34.63 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1885  degV family protein  40.64 
 
 
284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  32.62 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  33.22 
 
 
280 aa  163  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  33.22 
 
 
280 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  34.86 
 
 
286 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  35.21 
 
 
286 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  34.16 
 
 
287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  34.86 
 
 
286 aa  162  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  34.63 
 
 
286 aa  162  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0603  degV family protein  36.46 
 
 
282 aa  162  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0882391  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  34.28 
 
 
286 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  38.41 
 
 
271 aa  159  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  30.94 
 
 
281 aa  159  5e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1266  degV family protein  36.16 
 
 
276 aa  158  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  33.57 
 
 
287 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  41.82 
 
 
296 aa  157  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  36.11 
 
 
279 aa  153  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  37.86 
 
 
282 aa  153  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0600  degV family protein  34.42 
 
 
683 aa  152  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5472  degV family protein  38.33 
 
 
326 aa  152  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  31.07 
 
 
303 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  40.36 
 
 
280 aa  152  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  31.79 
 
 
290 aa  152  8e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  37.09 
 
 
279 aa  151  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  32.62 
 
 
293 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  37.41 
 
 
285 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  37.5 
 
 
283 aa  150  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  32.51 
 
 
285 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2272  hypothetical protein  39.57 
 
 
282 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  31.29 
 
 
281 aa  149  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  34.15 
 
 
285 aa  149  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  39.07 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12580  degV family protein  40.93 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3849  degV family protein  40 
 
 
286 aa  146  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2832  degV family protein  31.21 
 
 
281 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2518  degV family protein  31.21 
 
 
281 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  32.03 
 
 
282 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  29.51 
 
 
292 aa  143  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  31.07 
 
 
284 aa  143  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3519  degV family protein  34.64 
 
 
281 aa  142  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.945793  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  33.09 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>