60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0920 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0920  FmdB family regulatory protein  100 
 
 		 65 aa  134  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000112194  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2257  regulatory protein, FmdB family  56.52 
 
 		 61 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0637  regulatory protein, FmdB family  42.86 
 
 		 69 aa  53.5  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0829  hypothetical protein  40.43 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000274329  normal  0.31982 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2457  FmdB family regulatory protein  37.5 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1775  FmdB family regulatory protein  32.76 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1432  hypothetical protein  38 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1552  hypothetical protein  38 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  38.1 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1633  FmdB family regulatory protein  39.13 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1567  FmdB family regulatory protein  39.13 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  32.26 
 
 		 73 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01549  putative regulatory protein, FmdB family  44 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0204  regulatory protein, FmdB family  33.33 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4412  hypothetical protein  35.71 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1941  FmdB family regulatory protein  31.82 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0534197  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2088  regulatory protein, FmdB family  33.82 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1172  FmdB family regulatory protein  37.88 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0428  hypothetical protein  36 
 
 		 91 aa  45.1  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.575896  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1745  FmdB family regulatory protein  36 
 
 		 91 aa  45.1  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.195874  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2262  hypothetical protein  42 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.545917 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1970  hypothetical protein  35.71 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2798  regulatory protein, FmdB family  33.33 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  33.33 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2706  FmdB family regulatory protein  34.62 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.589032 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2386  hypothetical protein  38 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.954945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2275  regulatory protein, FmdB family  33.85 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1544  regulatory protein, FmdB family  36.73 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00857595  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4206  FmdB family regulatory protein  35.71 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2431  FmdB family regulatory protein  33.33 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000696876  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2392  regulatory protein, FmdB family  32.26 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2774  regulatory protein, FmdB family  31.82 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2625  regulatory protein, FmdB family  37.5 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.874466  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1212  hypothetical protein  33.33 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1241  FmdB family regulatory protein  33.33 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  33.77 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0742  FmdB family regulatory protein  33.82 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.105899  normal  0.441026 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2036  hypothetical protein  38.1 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000459423  normal  0.717478 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3239  regulatory protein, FmdB family  37.04 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.688496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3407  FmdB family regulatory protein  35.19 
 
 		 142 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200356  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4003  FmdB family regulatory protein  30.95 
 
 		 73 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2352  FmdB family regulatory protein  36.73 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0363  regulatory protein, FmdB family  31.34 
 
 		 71 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.232661  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1843  hypothetical protein  35.71 
 
 		 85 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00987876  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3290  hypothetical protein  31.82 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0708  FmdB family regulatory protein  37.5 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.001557  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3203  hypothetical protein  33.85 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3859  putative formamidase regulatory protein FmdB  37.04 
 
 		 117 aa  41.2  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1673  hypothetical protein  35.71 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0778  regulatory protein, FmdB family  45.24 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1596  hypothetical protein  41.86 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000473565  normal  0.661888 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2195  FmdB family regulatory protein  41.86 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  30.95 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1521  FmdB family regulatory protein  33.33 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10251 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0086  regulatory protein, FmdB family  41.86 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.576483  hitchhiker  0.00282506 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2573  regulatory protein, FmdB family  33.33 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135331 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0912  hypothetical protein  35.71 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  2.32009e-16  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2603  regulatory protein, FmdB family  32.56 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000406925  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12110  putative regulatory protein, FmdB family  40 
 
 		 95 aa  40  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.562196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>