127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0558 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0558  aluminium resistance family protein  100 
 
 
433 aa  860    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1879  aluminium resistance family protein  65.27 
 
 
413 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000283572  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2133  Aluminium resistance family protein  64.18 
 
 
415 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.821926  normal  0.0213182 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0794  aluminium resistance protein  56.8 
 
 
430 aa  476  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0594  Aluminium resistance family protein  55.58 
 
 
428 aa  472  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000910019  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1920  Aluminium resistance family protein  60.15 
 
 
417 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2378  aluminium resistance family protein  51.88 
 
 
434 aa  441  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00133186  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1618  aluminium resistance family protein  50.61 
 
 
424 aa  443  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0222221  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2723  Aluminium resistance family protein  52.54 
 
 
420 aa  428  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.839574  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1005  putative aluminum resistance protein  52.54 
 
 
411 aa  421  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000549762  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2115  Aluminium resistance family protein  50.73 
 
 
423 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1233  Aluminium resistance family protein  47.22 
 
 
422 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289553  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2562  aluminum resistance protein-like  54.95 
 
 
409 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.514421  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1366  hypothetical protein  47.82 
 
 
412 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1392  hypothetical protein  47.82 
 
 
412 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0874  hypothetical protein  47.41 
 
 
412 aa  414  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2383  aluminium resistance family protein  46.94 
 
 
423 aa  412  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.187803  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1175  aluminum resistance protein  51.7 
 
 
426 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.446504  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3805  aluminum resistance protein  47.19 
 
 
423 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1496  Aluminium resistance family protein  49.63 
 
 
426 aa  408  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000675206  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3733  hypothetical protein  46.7 
 
 
423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3551  hypothetical protein  46.7 
 
 
423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3451  aluminum resistance protein  46.7 
 
 
423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3464  aluminum resistance protein  46.94 
 
 
423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3835  hypothetical protein  46.7 
 
 
423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1362  aluminum resistance protein  51.17 
 
 
426 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00883878  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3553  aluminum resistance family protein  50 
 
 
409 aa  405  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.916774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3756  aluminum resistance protein  46.94 
 
 
423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00841285  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1500  aluminum resistance protein  47.19 
 
 
423 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0198374 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3471  aluminium resistance family protein  46.45 
 
 
423 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0016496  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3715  aluminum resistance protein  46.7 
 
 
423 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2242200000000003e-18 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4213  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  49.75 
 
 
409 aa  401  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.226781  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1438  aluminium resistance  50.13 
 
 
416 aa  399  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.406452  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3348  Aluminium resistance family protein  49.39 
 
 
410 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4811  Aluminium resistance family protein  50.51 
 
 
432 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.851244  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0663  Aluminium resistance family protein  50.13 
 
 
407 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0641  Aluminium resistance family protein  49.87 
 
 
407 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2540  hypothetical protein  52.23 
 
 
430 aa  385  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1571  Aluminium resistance family protein  51.48 
 
 
422 aa  383  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1119  aluminium resistance  56.01 
 
 
431 aa  381  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.165119  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1503  Aluminium resistance family protein  49.15 
 
 
427 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000404757 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2190  hypothetical protein  49.36 
 
 
448 aa  366  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28921  cystathionine beta-lyase family aluminum resistance protein  49.38 
 
 
433 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0951  Aluminium resistance family protein  46.29 
 
 
425 aa  367  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1269  cystathionine beta-lyase family aluminum resistance protein  44.44 
 
 
421 aa  363  2e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21401  cystathionine beta-lyase family aluminum resistance protein  44.2 
 
 
421 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17971  cystathionine beta-lyase family aluminum resistance protein  43.6 
 
 
433 aa  358  9e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18601  cystathionine beta-lyase family aluminum resistance protein  41.46 
 
 
430 aa  346  4e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1882  cystathionine beta-lyase family protein  42.86 
 
 
422 aa  346  5e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000688735 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1762  cystathionine beta-lyase family aluminum resistance protein  40.94 
 
 
430 aa  342  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18601  cystathionine beta-lyase family aluminum resistance protein  40.88 
 
 
430 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18791  cystathionine beta-lyase family aluminum resistance protein  41.04 
 
 
430 aa  336  5.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  29.55 
 
 
398 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  29.55 
 
 
397 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  30.22 
 
 
398 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  30.57 
 
 
398 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  30.67 
 
 
400 aa  60.8  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3473  cystathionine gamma-synthase  27.34 
 
 
372 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.400432  normal  0.010715 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  31.84 
 
 
399 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  29.39 
 
 
399 aa  54.7  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0481  O-acetylhomoserineaminocarboxypropyltransferase  27.34 
 
 
422 aa  55.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3411  Cystathionine gamma-synthase  29.02 
 
 
395 aa  54.3  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  29.96 
 
 
396 aa  53.9  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0357  hypothetical protein  24.26 
 
 
364 aa  53.1  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43850  Cystathionine gamma-synthase  32.32 
 
 
396 aa  53.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.237057  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4139  methionine gamma-lyase  28.92 
 
 
390 aa  52.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1055  cystathionine gamma-synthase  29.44 
 
 
380 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1004  cystathionine gamma-synthase  29.35 
 
 
394 aa  49.7  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.567061  hitchhiker  0.000527266 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  26.99 
 
 
418 aa  48.5  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2294  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  26.75 
 
 
402 aa  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.732113  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0225  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  25.2 
 
 
424 aa  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.707293  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  30.36 
 
 
383 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6766  hypothetical protein  26.62 
 
 
390 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  26.32 
 
 
397 aa  47.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  23.83 
 
 
401 aa  47.4  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01740  cystathionine beta-lyase, putative  25.24 
 
 
900 aa  47.4  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  33.33 
 
 
382 aa  47.4  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1994  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  28.02 
 
 
467 aa  47.4  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  29.15 
 
 
377 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  27.49 
 
 
391 aa  47  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2044  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  28.02 
 
 
431 aa  47  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0010  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  24.62 
 
 
428 aa  47  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1995  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  26.5 
 
 
403 aa  46.6  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2132  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  29.28 
 
 
422 aa  46.6  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  30.93 
 
 
381 aa  46.6  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1403  cysteine desulphurase-like protein  30.16 
 
 
383 aa  46.6  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6803  cystathionine gamma-synthase  26.56 
 
 
389 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4838  cystathionine gamma-synthase  26.82 
 
 
389 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.370286 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  24.17 
 
 
399 aa  46.6  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0819  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  29.28 
 
 
467 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1146  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  24.76 
 
 
429 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000163408  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1453  O-acetylhomoserine sulfhydrylase  25.81 
 
 
430 aa  45.8  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000343042  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4283  cystathionine gamma-synthase  27.27 
 
 
389 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940043  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1615  cystathionine beta-lyase  26.96 
 
 
399 aa  45.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.566516  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  28.82 
 
 
400 aa  45.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1842  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  24.71 
 
 
430 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000076838  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2097  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  23.28 
 
 
431 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  39.08 
 
 
394 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  27.32 
 
 
394 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4793  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  28.06 
 
 
426 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>