109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4141 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  735    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  56.56 
 
 		 395 aa  413  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  43.73 
 
 		 379 aa  315  6e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  47.18 
 
 		 373 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  44.41 
 
 		 395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  41.97 
 
 		 381 aa  291  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  42.48 
 
 		 1101 aa  278  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0354  hypothetical protein  40.93 
 
 		 387 aa  265  8.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0140  FIST C domain protein  41.41 
 
 		 379 aa  262  6.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0331  hypothetical protein  40.66 
 
 		 387 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3184  hypothetical protein  40.62 
 
 		 377 aa  248  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3884  domain of unknown function DUF1745  38.59 
 
 		 1852 aa  221  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  31.79 
 
 		 401 aa  160  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  30.94 
 
 		 400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  29.89 
 
 		 408 aa  153  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  30.42 
 
 		 417 aa  149  9e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  27.62 
 
 		 383 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  27.17 
 
 		 389 aa  123  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  25.94 
 
 		 402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  26.92 
 
 		 932 aa  110  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0294  hypothetical protein  27.36 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  25.33 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  26.98 
 
 		 396 aa  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  25.15 
 
 		 629 aa  106  5e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1204  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  27.98 
 
 		 931 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271509 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  25.14 
 
 		 933 aa  105  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  25.89 
 
 		 396 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  26.9 
 
 		 387 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  27.39 
 
 		 934 aa  100  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  27.87 
 
 		 376 aa  97.8  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  24.8 
 
 		 396 aa  96.3  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  27.89 
 
 		 416 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2389  GGDEF family protein  30.42 
 
 		 829 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  27.16 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4044  hypothetical protein  28.72 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  25.14 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1054  hypothetical protein  21.63 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0696  transcriptional regulator, TrmB  22.97 
 
 		 512 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002115  sensory box/GGDEF family protein  27.55 
 
 		 828 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00305  sensory transduction protein kinase  25.9 
 
 		 828 aa  67  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3254  domain of unknown function DUF1745  27.81 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1055  domain of unknown function DUF1745  32.2 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8558  hypothetical protein  27.89 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0688  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.48 
 
 		 951 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00399648  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0895  FIST C domain protein  24.44 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000443325  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0889  hypothetical protein  27.03 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3113  hypothetical protein  28.57 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.680527  hitchhiker  0.0000208643 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02432  hypothetical protein  25.1 
 
 		 391 aa  62  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3953  hypothetical protein  24.64 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2542  hypothetical protein  25 
 
 		 395 aa  59.3  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1139  hypothetical protein  27.79 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0732  hypothetical protein  26.35 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0128  hypothetical protein  25 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.193314  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0526  hypothetical protein  25.94 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0091  domain of unknown function DUF1745  30.27 
 
 		 383 aa  56.2  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1891  hypothetical protein  31.79 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2675  hypothetical protein  25.95 
 
 		 399 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0296571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2659  hypothetical protein  26.59 
 
 		 406 aa  54.3  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1816  protein of unknown function DUF1745  27.65 
 
 		 389 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.988519 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1527  hypothetical protein  26.38 
 
 		 390 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.039182 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3518  hypothetical protein  27.38 
 
 		 400 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.689004 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0444  hypothetical protein  30.34 
 
 		 412 aa  53.5  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2881  hypothetical protein  27.98 
 
 		 390 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2474  hypothetical protein  23.01 
 
 		 447 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0438  domain of unknown function DUF1745  27.67 
 
 		 398 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1561  hypothetical protein  18.62 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0408772  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3246  domain of unknown function DUF1745  24.23 
 
 		 396 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116005  normal  0.61148 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1925  hypothetical protein  27.65 
 
 		 398 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.795435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2201  domain of unknown function DUF1745  27.65 
 
 		 398 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1661  hypothetical protein  25.71 
 
 		 384 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1717  hypothetical protein  25.71 
 
 		 392 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1924  hypothetical protein  25.71 
 
 		 392 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2313  GfdT protein  25.71 
 
 		 392 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0600  hypothetical protein  25.71 
 
 		 392 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2052  domain of unknown function DUF1745  23.18 
 
 		 379 aa  50.1  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3242  domain of unknown function DUF1745  29.31 
 
 		 371 aa  49.7  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0186777  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0710  hypothetical protein  25.71 
 
 		 384 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2230  hypothetical protein  25.71 
 
 		 392 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2191  diguanylate cyclase  24.6 
 
 		 806 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00068502 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0466  domain of unknown function DUF1745  23.96 
 
 		 385 aa  48.9  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1561  hypothetical protein  26.23 
 
 		 404 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1434  domain of unknown function DUF1745  22.69 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318192  normal  0.236861 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  24.29 
 
 		 460 aa  47.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3140  hypothetical protein  26.17 
 
 		 387 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3362  hypothetical protein  24.5 
 
 		 377 aa  47  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.103972 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  22.27 
 
 		 400 aa  46.6  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2663  hypothetical protein  26.17 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3617  hypothetical protein  26.01 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0308687  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1883  hypothetical protein  24 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38990  hypothetical protein  27.36 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.880326  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1939  hypothetical protein  25.1 
 
 		 384 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0700  hypothetical protein  26.44 
 
 		 380 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal  0.0832434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2171  hypothetical protein  25.7 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2247  hypothetical protein  23.48 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.316904 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1108  domain of unknown function DUF1745  26.18 
 
 		 378 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0913  domain of unknown function DUF1745  27.5 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1387  hypothetical protein  26.18 
 
 		 378 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0940  domain of unknown function DUF1745  27.5 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05570  hypothetical protein  27.66 
 
 		 387 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3551  hypothetical protein  24.93 
 
 		 371 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>