62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3914 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3914  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  486  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0300  hypothetical protein  40.42 
 
 		 248 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  39.6 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2202  hypothetical protein  38.96 
 
 		 251 aa  151  8.999999999999999e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0392424  normal  0.159254 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  40.68 
 
 		 260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  40.68 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4196  hypothetical protein  39.48 
 
 		 251 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.690464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4590  hypothetical protein  39.91 
 
 		 255 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1069  hypothetical protein  38.63 
 
 		 251 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1029  hypothetical protein  38.63 
 
 		 251 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1027  hypothetical protein  38.43 
 
 		 251 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  35.56 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  34.93 
 
 		 245 aa  99  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  30.93 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  30.93 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  34.78 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5609  protein of unknown function DUF81  37.78 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2312  putative integral membrane protein  31.55 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2199  hypothetical protein  24.63 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.496547  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13510  protein of unknown function DUF81  27.69 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1978  hypothetical protein  24.76 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  hitchhiker  0.00218307 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1997  hypothetical protein  24.76 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00150485  hitchhiker  0.00000598022 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2307  hypothetical protein  25.12 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0952634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2084  permease  25 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000225949  decreased coverage  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  30.73 
 
 		 262 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2148  hypothetical protein  30 
 
 		 343 aa  52  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3601  hypothetical protein  27.27 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816933  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2158  protein of unknown function DUF81  22.5 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0322599  hitchhiker  0.000748002 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  30.99 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2208  protein of unknown function DUF81  23.65 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0668214  normal  0.605026 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1879  hypothetical protein  25.81 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.518881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2371  hypothetical protein  34.45 
 
 		 271 aa  49.7  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.643122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  28.7 
 
 		 291 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3677  hypothetical protein  25.46 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2863  hypothetical protein  29.37 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0601492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  31.38 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01280  protein of unknown function DUF81  24.53 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  25.34 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  27.85 
 
 		 291 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  27.85 
 
 		 291 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  27.85 
 
 		 291 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2544  protein of unknown function DUF81  31.25 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4518  hypothetical protein  27.62 
 
 		 255 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.535232 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2672  hypothetical protein  35.63 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  22.5 
 
 		 249 aa  46.6  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1099  putative integral membrane protein  25.82 
 
 		 255 aa  46.2  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2945  hypothetical protein  28.57 
 
 		 266 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3998  hypothetical protein  29.41 
 
 		 268 aa  45.4  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.192524  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  25.11 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  27.59 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0652  hypothetical protein  25.1 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2789  hypothetical protein  29.37 
 
 		 266 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0463907 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1995  hypothetical protein  25.73 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  24.58 
 
 		 240 aa  43.9  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  25.45 
 
 		 255 aa  43.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0160  hypothetical protein  31.33 
 
 		 250 aa  43.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3342  hypothetical protein  26.8 
 
 		 255 aa  42.7  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0831  protein of unknown function DUF81  30.77 
 
 		 253 aa  42.7  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3041  hypothetical protein  33.33 
 
 		 266 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal  0.785978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3270  protein of unknown function DUF81  25 
 
 		 254 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1175  protein of unknown function DUF81  23.79 
 
 		 257 aa  42.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.358804  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2943  hypothetical protein  25.76 
 
 		 266 aa  42.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0381677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>