159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1462 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 348 aa  676    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  50.97 
 
 		 339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  47.73 
 
 		 339 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  47.27 
 
 		 363 aa  247  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  55.66 
 
 		 327 aa  244  9.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  47.13 
 
 		 363 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  45.86 
 
 		 339 aa  236  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  45.09 
 
 		 328 aa  236  6e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  44.98 
 
 		 335 aa  235  7e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  47.08 
 
 		 363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0126  cytochrome oxidase assembly  48.87 
 
 		 359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0109  cytochrome oxidase assembly  48.23 
 
 		 359 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.475032  normal  0.476439 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  45.45 
 
 		 325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  45.31 
 
 		 335 aa  233  5e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3040  cytochrome oxidase assembly  50.5 
 
 		 342 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00748587  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0072  cytochrome oxidase assembly  49.84 
 
 		 359 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0069  cytochrome oxidase assembly  46.96 
 
 		 368 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0043  putative cytochrome oxidase assembly protein  39.24 
 
 		 394 aa  227  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.484274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  46.3 
 
 		 327 aa  227  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0149  cytochrome oxidase assembly  51.75 
 
 		 345 aa  226  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  45.57 
 
 		 367 aa  225  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  43.6 
 
 		 325 aa  224  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0129  cytochrome oxidase assembly  50.48 
 
 		 357 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.96534 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0230  cytochrome oxidase assembly protein  43.53 
 
 		 353 aa  223  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  44.02 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  43.52 
 
 		 369 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  43.52 
 
 		 369 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  43.52 
 
 		 369 aa  219  7e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  43.23 
 
 		 369 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  43.23 
 
 		 369 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  43.23 
 
 		 369 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  43.23 
 
 		 369 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  43.23 
 
 		 369 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  43.93 
 
 		 370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  43.93 
 
 		 370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  43.64 
 
 		 370 aa  216  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  43.5 
 
 		 369 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  43.64 
 
 		 370 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4613  cytochrome oxidase assembly protein, putative  45.25 
 
 		 330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  42.95 
 
 		 326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01360  hypothetical protein  50 
 
 		 357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  45.37 
 
 		 327 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  46.43 
 
 		 392 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0124  cytochrome oxidase assembly  49.67 
 
 		 359 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190927  normal  0.0274429 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0187  hypothetical protein  50 
 
 		 357 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  43.35 
 
 		 370 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  41.62 
 
 		 404 aa  208  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4187  cytochrome oxidase assembly  44.2 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4119  cytochrome oxidase assembly  44.2 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0148  cytochrome oxidase assembly  43.89 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3490  cytochrome oxidase assembly  45.23 
 
 		 327 aa  207  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  44.51 
 
 		 391 aa  206  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  43.06 
 
 		 370 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4318  cytochrome oxidase assembly  44.2 
 
 		 325 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  44.02 
 
 		 383 aa  205  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  42.34 
 
 		 369 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3523  cytochrome oxidase assembly  44.34 
 
 		 326 aa  203  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  43.24 
 
 		 369 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  42.73 
 
 		 370 aa  203  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00950  Cytochrome oxidase assembly protein  53.98 
 
 		 356 aa  202  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0318  cytochrome oxidase assembly  38.12 
 
 		 387 aa  202  8e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3827  cytochrome oxidase assembly  44.09 
 
 		 411 aa  200  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.502475 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  43.86 
 
 		 396 aa  199  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  43.86 
 
 		 399 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  40.66 
 
 		 376 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  48.69 
 
 		 361 aa  197  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0171  cytochrome oxidase assembly  44.58 
 
 		 327 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0629  putative cytochrome oxidase assembly protein  36.1 
 
 		 387 aa  187  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0712  cytochrome oxidase assembly protein  35.83 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809899  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4383  cytochrome oxidase assembly  43.77 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1688  cytochrome oxidase assembly  46.6 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3997  cytochrome oxidase assembly  40.8 
 
 		 352 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3798  cytochrome oxidase assembly  41.09 
 
 		 352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3871  cytochrome oxidase assembly  41.09 
 
 		 352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04027  cytochrome oxidase assembly protein  37.8 
 
 		 387 aa  179  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  41.12 
 
 		 373 aa  179  5.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1387  cytochrome oxidase assembly  44.98 
 
 		 407 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4065  cytochrome oxidase assembly  45.03 
 
 		 506 aa  175  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.328508  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04006  cytochrome oxidase assembly  41.88 
 
 		 354 aa  172  6.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1045  cytochrome oxidase assembly  47 
 
 		 356 aa  169  9e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2711  cytochrome oxidase assembly  38.44 
 
 		 375 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318505  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  36.1 
 
 		 671 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  30.72 
 
 		 311 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  26.83 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  36.98 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.705731 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  29.21 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  30.66 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  26.89 
 
 		 285 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04451  hypothetical protein  28.98 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.898486  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  23.4 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  30.95 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  26.04 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05011  hypothetical protein  28.16 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.550155  normal  0.119353 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  32.59 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  26.69 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1778  hypothetical protein  27.51 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  27.38 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  26.89 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  30.75 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  28.37 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>